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基因插入和缺失的评估

来源:科学网
摘要:随着测序技术的发展,多个物种基因组测序的完成,科学家们对基因的研究也越来越深入。在细菌的基因组中存在有很多基因插入和缺失的现象,基因的插入与缺失通常导致基因的缀块分布。评估基因存在和缺失的方法被广泛运用在细菌基因组进化的研究领域。2007年Zhaxybayeva等科学家的研究表明,基因存在的错误诊断和未检测到的......

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随着测序技术的发展,多个物种基因组测序的完成,科学家们对基因的研究也越来越深入。在细菌的基因组中存在有很多基因插入和缺失的现象,基因的插入与缺失通常导致基因的缀块分布。评估基因存在和缺失的方法被广泛运用在细菌基因组进化的研究领域。

  

2007年Zhaxybayeva等科学家的研究表明,基因存在的错误诊断和未检测到的存在基因可能导致基因获得系统性过度评估。而最近,加拿大麦克马斯特大学的Weilong  Hao和Golding研究认为,注释错误可能引起更多复杂的影响,而不一定是系统性的,当前的注释打分是研究基因缺失的最好方法。基因获得和丢失基因组评估并没有因为基因组注释中很小的不同而受到强烈影响,但受到相关基因家族数目的强烈影响。科学家通过使用不同的域值来评估基因插入和缺失率,结果显示,长度匹配的不同域值只能引起评估率的一些很小变化。但是新近分支的基因插入缺失率一样相对较高,这与长度匹配的域值无关。现有的数据表明,在最近转移的基因当中更趋向于基因截短,但基因截短的动力学过程还需要在基因组比较中进行更深入的研究。相关文章发表在爱思唯尔期刊《基因》(Gene)上。(科学新闻杂志  周媛媛/编译)
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