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科学家绘制出豇豆遗传谱

来源:国际农业生物技术周报
摘要:据一项由加州大学河滨分校(UCR)科学家带领的研究小组报告,他们已经绘制出豇豆的高密度连锁图谱(Vignaunguiculata)。豇豆是一种蛋白质丰富的豆类作物,在数百万人的饮食和经济中发挥了重要作用。由于其顽强的品质,豇豆在维持亚洲和拉丁美洲的干旱易发地区,特别是撒哈拉以南非洲地区的粮食安全方面发挥了关键作用。......

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据一项由加州大学河滨分校(UCR)科学家带领的研究小组报告,他们已经绘制出豇豆的高密度连锁图谱(Vigna  unguiculata)。豇豆是一种蛋白质丰富的豆类作物,在数百万人的饮食和经济中发挥了重要作用。由于其顽强的品质,豇豆在维持亚洲和拉丁美洲的干旱易发地区,特别是撒哈拉以南非洲地区的粮食安全方面发挥了关键作用。尽管很重要,但有关豇豆的可参考的基因组信息却很有限。

研究人员整合了183000多种能够识别可能标记的表达序列标签(ESTs)的序列数据。从这些ESTs得到的SNP信息中获取了10000个高信任的SNPs,从而开发了Illumina公司的GoldenGate基因型芯片。研究人员接着应用这些芯片检测了来自6个正在图谱绘制中的品种的741个重组杂交系,他们发现约90%的SNP位点可认为是豇豆的遗传标记。约900种这些标记被整合到这张高密度连锁图谱中。由此产生的图谱长680cm,包括11个连锁群,标记的平均距离为0.73cm。

研究人员发现豇豆与大豆的基因组非常相关。“在物种之间有相当的基因序列是保守的”,  加州大学的研究员Philip  Roberts说,“通过在红豆染色体中寻找标记,我们可以相互参考这些标记信息,例如研究大豆中基于DNA序列的标记。这些将有利于知识在物种之间的交流,在红豆研究中取得的进展可以转化为大豆研究的有益信息,反之亦然。”
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