2009年12月22日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所与荷兰绿色
遗传研究所在北京举行了中-荷黄瓜基因组合作项目签字仪式。蔬菜花卉所杜永臣所长，黄三文博士和荷兰绿色遗传研究所的Bernard de Geus博士分别在合作协议上签字。中国农业科学院国际合作局贡锡锋副局长，科技局戴小枫副局长，荷兰驻华大使馆科技参赞Henk van Duijn先生出席了签字仪式。
该合作项目是蔬菜花卉所在黄瓜基因组序列完成的基础上，为进一步挖掘黄瓜基因组的信息，充分利用荷兰种子公司已有的研究基础，进一步精确地注释黄瓜基因，挖掘重要基因，开展黄瓜基因组后续研究。该项目总经费为100万欧元，荷方为获得黄瓜基因组数据使用权支付25万欧元。根据协议，中方将向荷方授权使用黄瓜基因组数据，荷方将产生近100个组织的表达谱序列信息，中方利用这些信息改善黄瓜基因组已有的基因注释，供荷方使用，双方还将利用基因组序列开展重要农艺性状方面的合作。
项目中方协调单位是中国农业科学院蔬菜花卉研究所，参加单位有北京市农林科学院蔬菜研究中心、天津科润黄瓜研究所、深圳华大基因研究院、北京师范大学、中国农业大学和上海交通大学；荷方项目协调单位为绿色遗传研究所，参加单位有Rijk Zwaan、Nickerson Zwaan、Takii Europe、Nunhems种子公司和瓦赫宁根大
签字仪式前，黄三文博士首先介绍了中荷黄瓜基因组合作项目的背景，合作的研究内容和将要取得的成果。贡锡锋副局长在讲话中指出，黄瓜基因组研究已经取得了很大的成果，希望能通过此次合作，进一步促进中荷双方全方位的合作，取得更大的成果。Bernard de Geus博士表示，荷方很高兴能与中方在这方面开展合作，黄瓜基因组是利用新一代测序技术取得的成果，这一技术的快速发展必将加速黄瓜育种的进程。Henk van Duijn参赞也表示，中国近年来发生了很大变化，在科学技术研究上也取得了长足的进步，黄瓜基因组测序顺利结束，就说明了这一点，我们愿意利用你们的研究成果，提高荷兰黄瓜研究水平，并希望将来能在蔬菜新技术领域开展更多的合作。
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