研究发现淡水趋磁球菌的分子检测方法

趋磁细菌是一类能够在细胞内合成纳米磁体矿或胶黄铁矿磁小体的原核微生物。研究趋磁细菌不仅为理解自然界铁元素的地球化学循环、生物磁性矿物合成等提供重要的新线索，而且趋磁细菌合成的纳米磁性矿物颗粒在医学和新材料方面具有重要的应用价值。查明自然界中趋磁细菌分布及其多样性还具有显著的环境生态学意义。

前期研究已经发现趋磁细菌在湖泊与海洋沉积物中较为普遍存在，但问题是如何快速准确发现环境中趋磁细菌，为深入研究和开发利用提供依据。传统检测野生趋磁细菌的方法是利用其趋磁特性，通过人为施加磁场，将细菌从沉积物中分离。尽管该方法简便快速，但是检测结果往往受到施加磁场的强度、细菌数量、细菌游动能力以及收集时间等因素的制约。

近日，中科院地质与地球物理研究所地球深部结构与过程研究室博士研究生林巍和导师潘永信研究员，通过系统比较趋磁细菌的核糖体核糖核酸基因（16S  rRNA  gene）序列，设计出了针对淡水α-变形菌纲趋磁球菌的聚合酶链式反应（PCR）特异性引物（specific  primers），开发出有效检测该类细菌的新方法。该方法已成功应用于北京地区趋磁球菌的多样性分析。这种新的基因探针为研究趋磁细菌群落结构变化及其环境适应性提供了重要手段。上述成果发表在《国际微生物学》（International  Microbiology）上[Lin  and  Pan.  Specific  primers  for  the  detection  of  freshwater  alphaproteobacterial  magnetotactic  cocci.  International  Microbiology,  2009,  12(4):  237-242]。