一种用于高度复杂的玉米基因组靶向测序的新方法可能会引发重要农业作物的
遗传学研究革命。由于许多重要农业作物的基因组庞大且重复度极高,所以开发一种技术来将基因组拆开并进一步捕捉感兴趣的部分是一项具有重要意义的工作。以玉米为例,其基因组中只有15%的部分表现出序列变异。
这种两步序列捕捉方法不需要封阻DNA,它能阻止基因组中重复序列对捕捉过程的影响。封阻DNA是一种特异性试剂,针对每一个物种大量生产高质量的试剂还存在技术上的困难。这种新方法不需要使用封阻DNA,其操作过程分为两步,首先利用基因芯片将重复顺序去除,然后再对特殊的目标片段进行捕捉。科学家们利用这种两步法成功的对玉米基因组中的目标序列进行几千倍的富集,覆盖度也达到了很高的水平。
“除了应用于农业系统外,这种技术还可直接用于森林树木等非食用作物,甘蔗、芒草等能源作物,以及一些植物药材等,它能帮助解决基因结构及基因进化方面的相关问题。上述作物的基因组比玉米大许多,其中大多数额外序列都是由重复DNA组成。”佛罗里达州立大学生物学助理教授Brad Barbazuk说。
作者:
2010-4-24