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Nature:GWAS应用于拟南芥

来源:Nature中文
摘要:大规模全基因组关联研究(GWAS)已成为人类基因组学中的一个重要工具,其关注焦点大多是疾病,但也关注肤色等适应性变异。Atwell等人报告了对自然出现的近交系拟南芥中的超过100种基因型所做的一项GWA研究。利用正向遗传学和GWA分析,他们发现,拟南芥单一位点(ACD6)上的变异是造成植物生长及抗感染能力方面的表现型变......

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大规模全基因组关联研究(GWAS)已成为人类基因组学中的一个重要工具,其关注焦点大多是疾病,但也关注肤色等适应性变异。现在,这种方法被发现在植物中也同样有用。Atwell等人报告了对自然出现的近交系拟南芥中的超过100种基因型所做的一项GWA研究。他们获得的结果从“有显著关联”(通常是对单个基因)到“比较难以解读的发现”都有,这说明复杂遗传因素和种群结构交互影响。

由Todesco等人发表的另一篇相伴的论文显示了这种方法检测“主要影响”基因位点的能力。利用正向遗传学和GWA分析,他们发现,拟南芥单一位点(ACD6)上的变异是造成植物生长及抗感染能力方面的表现型变异的原因。由这个位点上的等位基因之一所调控的抵抗力的显著增强,可以解释它为什么能在全世界的自然种群中持久存在,尽管这会大大减少新叶的生成。
作者: 2010-6-5
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