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浙大副教授发《Plant Cell》文章

来源:生物通
摘要:文章的通讯作者是浙江大学生科院陈新副教授,早年毕业于上海交通大学,曾在新加坡国立大学获得博士学位,主要研究领域包括,计算机辅助药物设计,生物信息的表示和数据挖掘,统计(机器)学习方法的生物学应用和代谢-调控网络分析。...

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来自浙江大学生命科学学院的研究人员建立了拟南芥分子相互作用网络预测数据库,并提出了基于网络拓扑结构的系统生物学分析方法,这是最为全面的拟南芥分子相互作用网络,相关研究成果公布在植物学权威刊物《The  Plant  Cell》杂志上。



文章的通讯作者是浙江大学生科院陈新副教授,早年毕业于上海交通大学,曾在新加坡国立大学获得博士学位,主要研究领域包括,计算机辅助药物设计,生物信息的表示和数据挖掘,统计(机器)学习方法的生物学应用和代谢-调控网络分析。



这篇题为“The  predicted  Arabidopsis  interactome  resource  and  network  topology-based  systems  biology  analyses”的文章通过整合分子相互作用的多种侧面证据,建立了目前最为全面的拟南芥分子相互作用网络,可覆盖24%的所有可能相互作用,单个预测相互作用的可靠性大于40%。



进一步分析表明,尽管这一组预测相互作用的覆盖面仍然有限,但它们已经能够反映很多高级生命系统(生物途径和生物过程)之间的关联,可以支持生物途径交互关系分析、基因功能预测、寻找表达变化不显著的关键调控基因等多种重要的系统生物学分析。很多在该预测网络发布后新发表的生物学关联可以从这一预测网络的拓扑结构中发现。



陈新课题组的核心研究方向是在分子相互作用网络的层面上研究药物多靶标协同调控的理论。目前正在进行人类分子相互作用网络的重建,以分析已知有效的多成分药物协同作用产生治疗效果的分子机制。



实验室网站:http://www.cls.zju.edu.cn/rlibs/
作者: 2011-4-2
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