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刚刚过去的一年内，也就是自2012年9月24日到2013年9月23日，中国学者发表在《自然》系列杂志上的论文总数量达到458篇，其中论著类论文443篇，综述类论文15篇（澳大利亚最多45篇）；同期日本学者450篇，其中论著类论文437篇，综述类论文13篇。中国学者论文数量比日本学者论文数量多8篇。中国各学术机构中，发表论文数量最多的是中国科学院共190篇，占总数的41.5%。排列在前十名的机构分别是中国科技大学33篇、清华大学40篇、北京大学49篇、华大32篇、南京大学17篇、香港大学26篇、厦门大学11篇、上海交通大学33篇、浙江大学20篇。也许有人有疑问，排名似乎不是按照论文的绝对数量，确实如此，这是因为自然有一个校对指数，就是根据作者数量平均作为系数进行统计，例如有一篇论文10个作者，每个作者的论文系数是0.1，如果中国科技大学在这个论文中有3个作者，那么这个论文可以给纪录0.3分。这个指数肯定不是理想的评价指标，但总比单纯统计论文数量更好一些。
http://www.natureasia.com/en/publishing-index/asia-pacific/by-country
似乎我们应该庆祝我们终于成为亚洲第一，但我们不要高兴太早，按照自然指数的排名，我们目前仍排第二，因为我们的自然论文发表指数只有215.57，而日本的是278.43，差距仍不小，比较乐观估计，2014年有望自然指数进入亚洲居首。当然，和美国相比，我们的差距仍十分巨大。但我们要有自信，因为我们的论文增加速度世界第一，而且不仅论文数量增加很快，高档次的论文也有很大提升。无论如何，这一时刻仍值得祝贺，因为这标志一个新的开端。
中国学术机构《自然》发表指数前50强
Institution
CC2
Articles3
1.
Chinese Academy of Sciences (CAS), China
60.29
190
2.
University of Science and Technology of China (USTC), China
13.51
33
3.
Tsinghua University, China
11.88
40
4.
Peking University, China
11.59
49
5.
BGI, China
9.63
32
6.
Nanjing University, China
7.51
17
7.
The University of Hong Kong (HKU), China
7.25
26
8.
Xiamen University, China
5.86
11
9.
Shanghai Jiao Tong University (SJTU), China
4.96
33
10.
Zhejiang University, China
4.66
20
11.
Fudan University, China
3.83
23
12.
Sun Yat-sen University, China
3.7
16
13.
Tianjin University, China
3.19
6
14.
China Agricultural University, China
2.88
8
15.
China University of Geosciences, China
2.62
5
16.
The Chinese University of Hong Kong, China
2.54
13
17.
Xi'an Jiaotong University, China
2.49
12
18.
Tongji University, China
2.23
12
19.
Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, China
2.02
14
20.
Beijing Normal University, China
1.95
4
21.
Huazhong University of Science and Technology (HUST), China
1.84
7
22.
Nanjing Medical University, China
1.7
11
23.
Anhui Medical University, China
1.67
9
24.
Tianjin Medical University, China
1.6
5
25.
Dalian University of Technology (DUT), China
1.54
3
26.
Chinese Academy of Agricultural Sciences (CAAS), China
1.51
9
27.
East China University of Science and Technology (ECUST), China
1.49
3
28.
Jilin University, China
1.44
7
29.
Hong Kong University of Science and Technology (HKUST), China
1.44
5
30.
Sichuan University, China
1.44
6
31.
Hunan University, China
1.4
3
32.
Chinese Center for Disease Control and Prevention (China CDC), China
1.37
7
33.
National Institute of Biological Sciences, Beijing (NIBS, Beijing), China
1.34
6
34.
Yunnan University, China
1.32
4
35.
The General Hospital of Chinese People's Liberation Army, China
1.27
3
36.
East China Normal University, China
1.24
6
37.
Southern Medical University, China
1.22
3
38.
Second Military Medical University, China
1.13
8
39.
Huazhong Agricultural University, China
1.1
6
40.
Central China Normal University, China
1
1
41.
Sichuan Agriculture University, China
1
1
42.
Linyi University, China
0.98
3
43.
Wuhan University, China
0.97
2
44.
South China Agricultural University, China
0.92
2
45.
Dalian National Laboratory for Clean Energy (DNL), China
0.9
3
46.
GlaxoSmithKline plc., China
0.88
2
47.
Fuzhou University, China
0.83
1
48.
Nankai University, China
0.78
7
49.
Qingdao University, China
0.75
1
50.
Yanshan University, China
0.73
1