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丹参（Salvia miltiorrhiza）是在亚洲国家非常流行的一种中药。它的干根含有丹参酮，原儿茶醛，丹酚酸B和迷迭香，常用于治疗多种疾病。microRNAs（miRNAs）参与植物的重要生物学过程，如器官发育，抗逆应答等。已有报道miRNAs调控植物次生代谢。然而，目前关于S. miltiorrhiza的miRNAs报道几乎没有。为此，杭州师范大学生命与环境科学学院王慧中教授和宋红苗副教授领衔的团队首次对S. miltiorrhiza的miRNA组进行了系统发掘，并探讨了miRNA在丹参酮合成中所发挥的功能*，研究成果发表在11月刊PLoS ONE上。
研究人员首先采用高通量测序技术分别对S. miltiorrhiza的根，茎，叶，和花的miRNA进行鉴定（小RNA测序项目由联川生物承担完成）。测序实验共鉴定出452个已知miRNAs和40个新miRNAs。在这些miRNAs中，62个miRNAs只在根中表达，95个miRNAs只在茎中表达，19个miRNA只在叶中表达，还有71个miRNAs只在花中表达。研究人员进一步采用降解组测序对miRNA调控的靶基因进行高通量鉴定。降解组测序分析鉴定出25个miRNA剪切调控的69个靶基因（降解组测序项目由联川生物承担完成）。在这些靶基因中，发现参与丹参酮合成的乙酰CoA酰基转移酶可被miR5072剪切调控。
此项研究为了解miRNAs在丹参中的组织特异性表达模式提供了重要信息，并为将来研究miRNA介导的丹参酮生物合成奠定了基础。
*Xu X, Jiang Q, Ma X, Ying Q, Shen B, et al. (2014) Deep Sequencing Identifies Tissue-Specific MicroRNAs and Their Target Genes Involving in the Biosynthesis of Tanshinones in Salvia miltiorrhiza. PLoS ONE 9(11): e111679.
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