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中医的生命力在于疗效，而目前的中医临床疗效评价标准已不适应中医发展的要求。在日前召开的第十届中华医学会临床流行病学年会暨第二届世界中医药学会联合会临床疗效评价学术交流会上，有关专家指出，中医临床评价完全可以借鉴现代医学评价体系的重要理念与方法，通过严谨的方案设计、严格的实施与质控，以保证结果的真实性，使获得研究结果的结论有充分的科学依据。
中国中医科学院副院长刘保延指出，目前中医药的临床疗效评价主要是照搬基于现代医学特点建立的评价体系及评价方法，对照研究方法要求干预因素越简单越好。但随着慢性疾病、多因素疾病的增多，其最有效的治疗方法是多种疗法的综合干预即复杂干预。中医药脑卒中单元就是典型的复杂干预，包括药物治疗、物理治疗、功能锻炼和健康教育等。怎么设计这类中医药复杂干预的临床疗效评价，用谁做临床疗效对照，类似问题都对目前的临床疗效评价体系提出了很大挑战。由于中医临床实践是辨证论治的个体治疗，其研究往往是针对复杂干预；而且中医的临床疗效评价往往又以人的状态变化为导向。因此，在中医临床疗效评价中，如果一味照搬现在的体系及方法会出现一个两难的问题：方法设计严格、质量高了，但评价不出治疗效果；能看到很好治疗效果的病例，却无法以设计严格、科学的方法进行疗效评价。刘保延认为，针对中医辨证论治的个体化治疗，着重对现行临床疗效评价体系及方法开展弥补和完善工作，力争建立起既可以使辨证论治个体化诊疗充分发挥，又能借鉴现代评价体系的方法，用科学数据客观展示辨证论治的效果，已成为中医药持续发展的关键问题。
由于国家“973”项目和国家自然基金立项支持，刘保延进行了“中医辨证论治疗效评价方法基础理论研究”和“病症结合的中介-‘症’的分类规律研究”。从基础理论角度探讨了中医临床研究的特点，提出并初步构建了辨证论治临床研究方法理论的框架，提出了辨证论治临床研究模式，为进一步构建适宜的中医临床评价体系提供了理论依据。此外，在北京市重大科技项目“中医药防治重大疾病临床个体诊疗评价体系的研究”支持下，刘保延还进行了辨证论治临床科研一体化技术体系的构建，采用人机结合方法，在推广应用学科概念规范的基础上，充分利用现代信息技术、数据统计、数据挖掘、人工智能等方法，在保证辨证论治个体化治疗的实践不被干扰的基础上，用科学数据展示研究结果、发现防治规律。据悉，目前该项目已通过验收，并荣获2007年度中华中医药学会科技奖一等奖。