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(1)致病性大肠杆菌肠炎
在我国比较常见。这种大肠杆菌不侵袭肠粘膜，也不产生肠毒素，主要病变在小肠和结肠。2岁以下的孩子发病多，特别是3个月以内的小婴儿病例最多，常在产院婴儿室或儿科新生儿室内发生流行。起病缓慢，不发热或低热，大便每日10多次，呈蛋花汤样，粘液多，有腥臭味，在显微镜下检查可见少量白细胞。大便培养有致病性大肠杆菌生长。大肠杆菌血清型O111引起的肠炎最重，治疗也较棘手。患儿常有轻～中度等渗或低渗性脱水，重度脱水比较少见。病程为1～2周。
(2)产毒性大肠杆菌肠炎
在发达国家中常见，发病率在婴幼儿腹泻中仅次于轮状病毒肠炎。这种大肠杆菌也不侵袭肠粘膜，但产生不耐热肠毒素和耐热肠毒素。潜伏期为1～2天，起病可急可缓。临床表现类似霍乱，一般不发热或发低热，腹泻多为水样便，量多，有腥臭味，在显微镜下检查无白细胞和红细胞，常有中、重度等渗或低渗性脱水。为自限性疾病，病程4～7天。
(3)侵袭性大肠杆菌肠炎
比较少见。这种大肠杆菌有侵袭肠粘膜的能力，该病主要病变在结肠，易有溃疡。潜伏期18～24小时。临床表现与细菌性痢疾相似，起病急，发热可达40℃，中毒症状重，大便次数较多，常带脓血，在显微镜下检查可见多数白细胞和红细胞，所以常误诊为细菌性痢疾，但大便培养无痢疾杆菌生长。
(4)出血性大肠杆菌肠炎
主要见于西方国家。这种大肠杆菌不侵袭肠粘膜，但能产生毒素，主要病变在结肠。潜伏期3～4天。临床表现为腹泻、恶心、呕吐、腹痛。腹泻开始为水样便，数日后变为肉眼血便，在显微镜下可见红细胞和白细胞。症状与侵袭性大肠杆菌肠炎相似，少数病儿可发生溶血性尿毒症。