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功能性低热的原因可能与体温调节中枢功能紊乱，或植物神经功能紊乱有关。此类低热包括原发性低热(体质性低热)、夏季热以及感染后低热。诊断功能性低热时，必须完全排除器质性疾病，并且要经过一段时间的动态观察，然后才可确定，切不可未经任何检查即做出盲目诊断。
对功能性低热的患儿使用退热剂治疗一般无效。可根据患儿的临床症状，采用适当的中药治疗。一般多用滋阴清热类中药，如生地、丹皮、知母、青蒿、鳖甲、地骨皮、沙参、麦冬之类。有些功能性低热的患儿未经特殊治疗，经过一段时间后亦自然缓解。