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2006年11月22日至11月24日，两年一度的全国高等医学教育学会基础医学分会及中华医学会医学教育分会基础医学教育研究会第六次学术大会在风景如画的杭州西湖湖畔如期举行。本次大会由浙江大学基础医学院主办，来自全国各地医学院校的约230位从事医学教育的老师与管理人员参加了会议。大会论文集收入了全国各地医学院校投给本次大会的论文216篇。教育部高教司副司长鲍朗、全国高等医学教育理事会理事长王德炳、原上海医科大学校长姚泰、北大基础医学院院长顾江等在开幕式上做了精彩报告，37位专家及与会代表做了专题报告及论文交流。
本次大会围绕着医学教育课程体系的改革、教学理念的更新、教学模式及方法的改进、学科建设、实验室建设及教学管理等方面展开交流与探讨。医学生学制的改革是大会的议题之一，有的学者认为学年学制的改革如何进行、进行到什么程度应与中国国情相结合，与各地的办学条件、师资力量相结合，不能一味照般国外模式；PBL教学是代表们探讨较多、实践也较多的内容之一，大家各抒己见，目前很多医学院校进行的PBL教学仅仅是一种教学方法上的改革，完全的PBL教学还包含了课程体系的改革，如系统教学；大会涉及教多的另一议题是我们如何从学习能力、思维方式、团队协作精神等综合素质方面着手，改进教学模式、教学方法，培养基础知识扎实又有创新能力的医学人才；教学管理则从如何主动应用科学的管理理念与方法着手进行探讨。
上海交大基础医学院撰写的20篇论文收入在大会论文集，内容涉及教学方法和手段、理论教学、实验室建设、双语教育、管理等方面，基础医学院的7位老师参加了本次学术年会，3人在会上做了论文交流，其中丁文龙教授在会上所做的大会报告“构建探究为基础的教学模式，培养学生的创新能力”，受到与会代表的高度关注及肯定，并荣获大会优秀论文一等奖。