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在原上海交通大学和上海第二医科大学合并二周年纪念之际，学校于7月18日上午在我院懿德楼二楼报告厅举行了“推进‘两个一流’建设工作会议”。校领导、医学院领导、校部和医学院各机关部处负责人、相关院系负责人、附属医院负责人和教师代表300余人参加了大会。上海市科教党委副书记、上海市教委主任沈晓明到会并讲话。会议由校长张杰主持。
校党委书记马德秀作了重要讲话，她首先回顾了两校合并两年来的主要进展和取得的成绩，她说：两校合并以来，呈现了稳定、有序、发展、共赢的基本态势，既增强了上海交大包括医学院在内的整体水平和竞争能力，又为学校未来发展奠定了扎实基础。在“建设两个一流、遵循两个规律”等思想的明确指导下，按照预期目标稳步推进校本部和医学院的发展融合，各项工作有序开展，各项事业持续发展，全校师生和医护员工普遍认同。
马书记还阐述了21世纪生命医学科学发展的国际和国内背景，并分析了学校在生命医学科学领域存在的优势和不足，提出学校发展将推行“蓝海战略”，发挥比较优势，即：善于和敢于出奇兵，出绝招，要人无我有，人有我优。要做别人想干而干不成的事，做别人不敢想而我们敢想、而又能做成的事。她号召大家要解放思想、开拓进取、奋发有为，更加自觉地把解放思想作为推进改革发展的基本要求，作为应对前进道路上各种新情况、新问题的一大法宝。在解放思想中真抓实干，在解放思想中破解难题。
马书记还从五大方面布置了将要重点推进的工作。一、以科学发展观为指导，深化落实发展理念：要坚定不移地继续高举发展的大旗、要坚持改革创新、要进一步增进文化认同；二、健全完善体制机制，进一步优化管理结构：要发挥好“部市共建”领导体制的作用、要进一步探索医学院的科学管理、要理顺附属医院的管理体制；三、瞄准现代医学发展方向，推进学科深层融合：要下决心把一批创新平台建成高峰、要进一步推动生农医药领域的协同发展；四、探索高层次医学人才培养新模式：要打造出八年制MD品牌，并要打造国际化品牌；五、加强战略谋划，用新思路盘活整体资源：要超前考虑211工程和985三期规划、要加大对附属医院医教研资源的战略整合、要认真做好校区规划等。
马书记最后还说：我们一定要团结一心，一定要珍惜当前的大好形势，珍惜难得的历史机遇，珍惜教育部及上海市各级领导的关心和支持。共同努力开创美好的前景，共同构建创新人才培养模式和学科发展机制，共同使合并后的潜在优势尽快转化为现实优势。
系统生物医学平台负责人赵立平和数字医学平台负责人冯大淦分别介绍了各自的研究进展和实施步骤等。基础医学平台负责人陈国强则对该平台建设做了5年的发展规划和展望。
副校长林忠钦就学校医工平台与基金实施办法做了说明，这一工作将于8月发布指南、9月项目评审、10月项目启动。重点项目包括了骨组织、神经组织的支架材料与生物力学；神经假体关键技术；重大疾病早期诊断仪器；重大疾病新型医疗技术；疾病诊断和疗效评估的方法和系统；医院信息管理系统；CAD/CAM技术与手术导航系统等。
校党委副书记、医学院党委书记赵佩琪宣读了首批12位同志挂职锻炼职务聘任的通知，并对挂职干部提出三点要求：一、要树立大局意识，合心合力、尽心尽力，为“两个一流”建设贡献智慧和力量；二、要保持良好精神状态，挂实职、干实事、创实绩；三、要虚心向周围同志学习，面对新岗位、新环境、新要求，努力学习新知识，掌握新方法，拓宽自己的视野，通过挂职锻炼自己的管理能力、组织实施能力和协调能力。
常务副校长叶取源就“推进公共学科融合，培养一流医学人才”为主题，对体育、外语、物理三个通识课程的融合工作做了说明。
挂职干部代表、院团委副书记何园，融合院系代表、外国语学院院长刘龙根在会上进行了发言。
副校长、医学院院长朱正纲就如何围绕学校学科发展与学科交叉融合的工作谈了想法。一、要进一步提高思想认识，改变观念，积极营造学科融合的文化范围，推进学科交叉融合，凝聚学科发展新的增长点。二、抓住机遇，加强工作力度，有序推进学科的交叉与融合。首先要加大通识基础学科融合的力度，稳步推进药学、生物医学工程学科的交叉与融合；其次，在学校的统一部署下，发挥学校和医学院的优势，积极推进医工结合；第三，要共同努力，加快建设生农医药生命科学合作大平台。
上海市科教党委副书记、上海市教委主任沈晓明是两校合并的亲历者和见证者。他在讲话中充分肯定了在交大党委的领导下，经过学校和医学院干部群众的共同努力，合并工作进展顺利，业务不断不乱，各项工作平稳过渡，强强联手、优势互补的效应开始显现。他还提出要聚焦发展、保持稳定，他说发展是学校的第一要务，而合并是有利于学科的交叉、融合和资源的优化配置的，在合并中遇到各种各样的问题是在所难免的，而且要改革、要创新，就要准许做探索，甚至要准备失败，但是不能往后退，需要大家发挥主观能动性，创造性地研究和解决。他希望在未来的发展中大家能够形成更大的合力，勇攀高峰，用科学的发展观来统领全校改革和发展工作，为上海的发展、为长三角的发展，为中国的发展做出更大的贡献。