日前,深圳华大基因研究院正式启动欧盟第七框架科技合作项目人体肠道元基因组(MetaHIT)研究计划的中国部分。据了解,深圳华大基因研究院作为唯一一个非欧盟正式成员,与另12个欧盟参与单位在法国Jouy-en-Josas研究中心共同发起了这一计划。深圳华大基因研究院将担负起项目中260个欧洲样本的测序工作及后续的生物信息学分析。
揭示肠道
微生物群“密码”
据介绍,人体与存在于体表和体内(大多数寄生在消化道内)的微生物关系密切。微生物的代表细菌,在数量上至少是人体自身细胞数量的10倍。而据推测,至少有80%的人体细菌种类依然不为人知。但这些微生物对维持人体健康如参与维生素合成、降解特定的不为人体吸收的化合物、提高人体免疫力等方面发挥着重要作用。
MetaHIT项目作为欧盟第七框架计划重点支持方向,就是要研究组成人体肠道微生物群落的基因组“密码”,通过比较健康个体与病人(如
肥胖症)的肠道菌群的组成,研究者可以在肠道元基因组水平上,了解这些疾病的特征,从而揭示其在营养与健康方面所起的重要作用。
研究包括菌群与肥胖的关联
深圳华大基因研究院的李松岗教授介绍,深圳华大基因研究院承担着MetaHIT项目的中国部分,包括担负该项目中260个欧洲样本的测序工作及后续的生物信息学分析。
据了解,该项目所采用的方法绕过了传统微生物研究中的分离培养步骤,将发展出一套全新的、研究肠道微环境多态性的生物学工具,从而探索肠道微环境与人类健康的关系,主要研究肠道菌群与肥胖或肠炎病理学的关联性。
项目参与者将共享资源
MetaHIT国际项目的协调人认为华大基因研究院拥有目前世界上最新的DNA 测序技术,正好适用于分析肥胖或肠炎等疾病与人体内细菌基因组之间的联系。华大人还将与上海的国家人类基因组南方中心一起,承担中法肠道元基因组合作项目的测序任务。
记者还了解到,该项目的参与者将共享资源,共同拓展专门的计算机技术和工具,整合现有的测序与分析力量,以完成这项富有挑战性的国际合作。整个项目的总投入接近2000万欧元。
作者:
2008-5-7