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反向斑点杂交技术检测泌尿生殖道沙眼衣原体及基因分型

来源:www.medcyber.com
摘要:272-2742(广州)为了建立反向斑点杂交技术,对泌尿生殖道沙眼衣原体感染进行检测和基因分型。研究者用0ligo软件设计寡核苷酸探针,采用巢式聚合酶链反应(PCR)扩增ompl基因的VS1-VS......

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2006年10月07日 中华皮肤科杂志 2006 Vol.39 No.5 P.272-274 2 (广州)为了建立反向斑点杂交技术,对泌尿生殖道沙眼衣原体感染进行检测和基因分型。研究者用0ligo软件设计寡核苷酸探针,采用巢式聚合酶链反应(PCR)扩增ompl基因的VS1-VS2序列,反向斑点杂交技术对沙眼衣原体进行检测和基因分型。结果巢式PCR扩增ompl基因的VS1-VS2序列的敏感性与质粒PCR符合率为98.2%(56/57)。优选出11条型特异性(A、B+Ba、C、D、E、F、G、H、I、J和K)和3条群特异性寡核苷酸探针:B群(B、Ba、D和E型),C群(A、C、H、I、J和K型)和中间群(F和G型)。特异性经过基因库中的BLAST程序比较和试验优化,结果显示各探针均与标准株呈特异性杂交。56例VS1-VS2 PCR阳性的临床标本杂交法检测均阳性,共检出59株沙眼衣原体,包括8个基因型,其中以E、F、D和H型为主,占77.9%,分别为25.4%,22.0%,16.9%和13.6%。发现3例混合感染占5.4%,分别为D/E、D/F和F/K。可见反向斑点杂交技术简便且快速,可直接对临床标本沙眼衣原体进行检测和基因分型。
作者: 2006-10-7
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