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基因增强子的时空分布

来源:Nature
摘要:确定增强子(可与调控蛋白结合来增强基因转录水平的短DNA片段)的时空分布,在人类基因组的功能注解方面仍是一个挑战。ChIP-seq(英文全称为“chromatinimmunoprecipitationwithmassivelyparallelsequencing”)的活体应用被用来描绘在发育中的小鼠组织中与增强子相关的蛋白p300在整个基因组范围的分布。在胚胎前脑、中脑......

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确定增强子(可与调控蛋白结合来增强基因转录水平的短DNA片段)的时空分布,在人类基因组的功能注解方面仍是一个挑战。ChIP-seq(英文全称为“chromatin  immunoprecipitation  with  massively  parallel  sequencing”)的活体应用被用来描绘在发育中的小鼠组织中与增强子相关的蛋白p300在整个基因组范围的分布。在胚胎前脑、中脑和四肢组织中,有几千个p300结合点,对其中的一个样本所做测试表明,它们大多数都与可重现的增强子活性有关。这种类型的数据集对于研究增强子在人体生物学及病理过程中的作用将是有用的。
作者: 2009-2-17
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