对比不同生物的基因组序列来建构它们的进化树是非常乏味和耗时的工作。通常科学家仅采用某些方法对生物中相同的小部分基因进行比较，但这些方法并不适用于远亲生物体比较。人们常用一些对比方法来判断计算机程序、书籍及其它一些出版物中是否存在剽窃的问题。受这些方法启发，加州大学伯克利分校的一个研究小组开发了一种改进的全基因顺序对比方法。
该项目首席研究员Sung-Hou Kim说：“在这种方法中，基因组被处理为一本没有空白的书籍。”他指出，该方法对生物的分组大致与目前分组方法相同，但存在一些差异。举例来说，本方法中各个群组在进化树中的相对位置与传统基因定位方法存在很大不同。
除了在基因组对比方面的应用外，Kim预计该方法将有助于追寻人类祖先，进行疾病统计，以及宏基因组数据分组。文章发表于最新的PNAS。
文章全文见
http://www.berkeley.edu/news/media/releases/2009/01/28_genomecomp.shtml
作者：
2009-3-3