DNA测序技术在过去的几年里得到了飞速的发展，测序通量在成倍增长而成本在成倍降低。地球上所有在科研、经济和生态上具有重要意义的物种都可能被测序。中国科学家近期成功获得家蚕的全基因组图谱，研究成果文章Complete Resequencing of 40 Genomes Reveals Domestication Events and Genes in Silkworm (Bombyx)发表在最新一期的Science上。
家蚕驯养已经有1万多年历史了。蚕为人类提供了宝贵的丝绸和蛋白。现在对蚕基因进行序列测试还为人们提供了一张有关这些随时会为我们提供如此多宝贵物质的昆虫的基因变异图。 Qingyou Xia及其同僚为29种家蚕和11种野蚕世系的基因组成功地进行了测序并找到了这些世系之间的差别。
他们发现，家蚕很明显地在基因上与其野生对应物不同，但即使在各家蚕世系之间，它们仍然维持着大量的变异性。这提示，家蚕只经历了一次牵涉有大量个体的单一且短暂的驯养过程，并在此后在家蚕与野蚕种群之间很少有基因流动。
Xia及其同僚还能够识别出特别的能够增进丝的生产、蚕虫的繁殖和生长的基因（这些基因很可能是被人类挑选出的）。他们甚至还寻找到了在驯养过程中由蚕虫所获取的行为特征，例如极端的拥挤和容忍人的靠近和操作，以及它们在驯养过程中所丧失的如逃逸及躲避掠食者和疾病等的特征。
（生物通 小茜）
由深圳华大基因研究院与西南大学合作的研究成果“40个基因组的重测序揭示了蚕的驯化事件及驯化相关基因”,今日在国际著名
学术杂志美国《SCIENCE》(《科学》)上发表,这是两家单位自2003年以来在家蚕基因组研究领域取得的又一项重要成果。
笔者昨日从深圳华大基因研究院了解到,这是该院继2008年11月6日在世界权威杂志英国《自然》上发表研究成果———第一个亚洲人基因组图谱后,再一次在世界权威杂志上发表研究成果。美国《科学》杂志与英国《自然》杂志是学术界并驾齐驱的两份极其重要的刊物。
据深圳华大基因研究院介绍,此次登上美国《SCIENCE》(《科学》)的研究共获得了40个家蚕突变品系和中国野桑蚕的全基因组序列,是多细胞真核生物大规模重测序研究的首次报道,共获得632.5亿对碱基序列(63.25Gb),覆盖了99.8%的基因组区域；绘制完成了世界上第一张基因组水平上的蚕类单碱基
遗传变异图谱,是世界上首次报道的昆虫基因组变异图；从全基因组水平上揭示了家蚕的起源进化；发现了驯化对家蚕生物学影响的基因组印记。
桑蚕大规模基因组重测序和遗传变异图谱构建的完成,有助于从全基因组范围研究驯化和人工选择对家蚕生物学的影响,阐释家蚕及野桑蚕之间生物学差异的遗传基础。更为重要的是,鉴于与野桑蚕相比,家蚕具有更优良的经济性状,研究所发现的全基因组选择印记,特别是那些受到强烈选择的具体基因,对家蚕重要优势经济性状相关基因克隆及其形成机理的研究至关重要。
作者：
2009-8-29