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新加坡科学家完成三大种族基因蓝图

来源:联合早报
摘要:完成基因蓝图的意义是,它标志着我们朝“个人化药物”迈进一步,因为只有当我们知道完整的基因谱,才能跟其它族群比对,然后找出导致我们更容易患某种病的基因位置,以此“对症下药”人类各种族的基因其实相似度高达99。1%的不同,造成各种族在患病时的几率也不同。1%的差别听起来很小,但从基因位置(geneticposition......

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  完成基因蓝图的意义是,它标志着我们朝“个人化药物”迈进一步,因为只有当我们知道完整的基因谱,才能跟其它族群比对,然后找出导致我们更容易患某种病的基因位置,以此“对症下药”  

  人类各种族的基因其实相似度高达99.9%,但就是因为那0.1%的不同,造成各种族在患病时的几率也不同。这0.1%的差别听起来很小,但从基因位置(genetic  position)来说,其实是个很大的区域,人类共有30亿个基因位置,0.1%是300万。  

  一组新加坡科学家花了一年半,完成了本地三大种族的基因蓝图,使我国成为世界上第一个完成该国人种基因蓝图的国家,而且一次过就包括了华、巫、印三个人种。  

  他们也将蓝图的资料放上网公开让科学界同僚免费参考,这种网上资料库目前只有两个。  

  完成基因蓝图的意义不只是象征性的,它更标志着我们朝“个人化药物”迈进一步,因为只有当我们知道完整的基因谱,才能跟其它族群作对比,然后找出导致我们更容易患某种病的基因位置,以此“对症下药”。  

  在这之前,唯一拥有人类基因蓝图的资料库是一项名叫“国际人类基因组单体型图”(简称HapMap)的计划,不过那是由加拿大、中国、日本、尼日利亚、英国和美国共同资助的,这些人种包括欧洲、非洲、日本和北京华人,资料也是在网上公开。  



  抽取华印巫300人基因  

  本地的这项计划名叫“新加坡基因组差异项目”(Singapore  Genome  Variation  Project),研究小组从华族、马来族和印族人口中,随机抽取了各100个正常人的血液样本提取基因,经淘汰后共有268人,所构成的基因单位或位置——单核苷酸多态性标记(简称SNP)有160万个,这个基因遗传标记被视为解开基因之迷的关键之一。  

  他们的报告收录在去年11月的《基因组研究》(Genome  Research)期刊里。  



  60台电脑花六个月分析基因图谱  

  虽然只有268个人,但研究小组组长、新加坡国立大学基因统计学家张毅颖副教授说,HapMap的人数也不过各种族不到60人,而且分析基因图谱非常耗费功夫,他们得用上60台电脑六个月的时间去分析。  

  张毅颖进一步解释,人类各种族的基因其实相似度高达99.9%,但就是因为那0.1%的不同,造成各种族在患病时的几率也不同。  

  这0.1%的差别听起来很小,但从基因位置(genetic  position)来说,其实是个很大的区域,人类共有30亿个基因位置,0.1%是300万,这当中,造成患某种病症几率增加的基因位置可能有10万到25万个。  

  他说,要找出确切的基因,最大的一个困难是基因位置互相关联,往往是只能找出一个区域,但找不出确切的基因位置。  

  “比如在一个区域里,欧洲糖尿病人中可能有60到100个基因位置与较高的患病几率相联,华人是50到100个,把多个种族进行重叠后,可能只有30个位置是相同的,如果再加上马来、非洲人种等等,或许能缩小到四或五个位置,以此来确定到底哪个位置是‘病灶’。”  

  那我们为什么不能随便找很多糖尿病人来提取基因资料呢?张教授解释,这是因为同种族(如中国华人和新加坡华人)之间的差异要比跨种族的小得多,所以种族越多,基因多样性越高、越能推断出基因在患病风险中扮演多重的角色。  

  他说,新加坡参与了几个大型的基因变化项目,其中一个是研究第二型糖尿病,目前有14个国家参与,不过他们还没找出是哪一个基因位置在作祟,其它受关注的病症包括癌症和近视等。  

  他说,目前科研人员还在搜集基因蓝图的阶段,世界上唯一已有突破的是疟疾,基因因素据说占了25%。  

  “所以有蓝图很重要,因为现在我们能从中了解正常人的基因构造,这将有助于我们对不同病状的基因要素有更彻底的了解。”  

  这组科学家共有11人,来自国大理学院统计与应用概率系、杨潞龄医学院流行病学和公共卫生部门、新加坡基因组研究院、牛津大学维康信托基金人类遗传中心(Wellcome  Trust  Centre  for  Human  Genetics)等。  

  他们的基因资料也放在分子流行病中心的网站里http://www.nus-cme.org.sg/SGVP
 

作者: 佚名 2010-2-17
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