Nat. Genet：影响HCV自我清除的新基因

    丙肝病毒的慢性感染会导致肝硬化和肝癌。在受到丙型肝炎病毒强烈感染的人群中，有多达80%的人不能清除病毒，并会逐渐发展为慢性丙型肝炎，其中约有5%会发展成肝癌。就现有的丙肝病毒感染治疗方法来说，非洲血统的患者对治疗的反应往往没有欧洲或亚洲血统的人好。在之前的研究中，全基因组关联分析(GWAS)已经确定了与HCV治疗和HCV感染的自发性清除相关的常见遗传性基因标志物。这些标志物位于第19号染色体，与一个已知的干扰素基因IFNL3的距离很近。然而，对IFNL3的分子研究并不能解释全基因关联分析与自发性病毒清除和治疗反应的联系。为了发现新的基因，这些调查者们利用一项RNA测序技术测定了感染HCV的人类肝细胞模型。           

    本研究的领导者之一Ludmila Prokunina-Olsson博士说：“通过利用RNA测序我们了解到了这一DNA区域中已知内容以外的信息。令人欣喜的是我们发现了一种新的基因。除此之外，利用这项技术来发现其它一些重要的基因也是有可能的。”研究人员发现，编码IFNL4的区域有一个突变体，它有两种可选的形式。其中一种形式被称为deltaG，它会导致组成DNA的四个碱基之一发生缺失。这一改变导致了基因移码，从而产生了IFNL4蛋白；而另一种没有缺失的形式则不能产生IFNL4。通过分析参与这项临床研究的感染HCV的美国黑人和美国白人，作者发现IFNL4蛋白的存在与较差的病毒自我清除和较差的病毒治疗反应有关。这一缺失突变体在美国黑人种族中更为普遍，这可能部分解释了为何非裔美国人对现有的HCV疗法的响应要比亚洲和欧洲血统的人差。