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Nature,Cell:改变进化基因组学研究方式

来源:生物通
摘要:群体遗传学和基因组测序研究领域的进展,能帮助我们识别出经过进化的未知DNA片段,这将能解答一些进化上的问题,也会带来更多的疑问。一组研究人员在最近的研究中采用了群体基因组学的方法分析狗基因组中在驯化过程中出现的选择变化,这种方法有望彻底改变进化生物学,挑战了之前基于表型的研究方法。他们首先寻找DNA中的......

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群体遗传学和基因组测序研究领域的进展,能帮助我们识别出经过进化的未知DNA片段,这将能解答一些进化上的问题,也会带来更多的疑问。

一个名为Banana Joe 的猴面犬(Affenpinscher)在上个月举行的威斯敏斯特养犬俱乐部狗秀中获得了最高荣誉,评判委员会宣布的获奖理由是“梦幻般的脸(和)巨大的身躯”。Joe成功的一些因素可能可以归结于人工培育的作用,但有时我们也会忽略掉狗其实是我们的同伴。在自然选择过程中,在过去的上万年间,它们也发生了生活方式和养分供应的演变。

一组研究人员在最近的研究中采用了群体基因组学的方法分析狗基因组中在驯化过程中出现的选择变化,这种方法有望彻底改变进化生物学,挑战了之前基于表型的研究方法。另外两篇来自Cell的文章也获得了相似的成果,表明关于某种自适应人类表型如何能通过可控实验,进行验证。

发表在Nature上的这篇文章从世界各地找来12只狼和14个品种的60只狗做DNA测序。他们首先寻找DNA中的单个碱基对,各个基因的碱基对是不同的,并以此确认大约400万组单核苷酸多态性(SNPs)。

研究人员从所有122组基因中发现了36组促使狗进化(区别于狼)的基因,其中在脑部基因中有8组是参与神经系统发育的,这些基因使得狗更加温顺,从而解释了狗如何过渡成为人类的好朋友。

并且他们也发现了狗有10个基因“在淀粉消化和脂肪代谢中很重要,而现代狗消化富含淀粉的食物要比肉食性的狼好”。 

而在另外的两篇Cell文章中,研究人员共同揭示了人类进化遗传突变的重要新发现,他们利用一种动物模型,分析了帮助人类适应自然气候的一个基因突变,并通过全基因组测序方法,还找到了随着时间的推移,可能出现的人类适应变化条件的上百种基因突变,这些发现将为我们了解人类生物学进化历史,以及现代出现的变异绘制一张路线图。

研究人员根据来自千人基因组计划的数据,分析了人类整个基因组中出现的DNA序列突变,从中他们发现了随着时间的推移,可能出现的人类适应变化条件的上百种基因突变。其中之一是一种称为TLR5的基因突变,这种基因突变改变了细胞对细菌蛋白的免疫应答,这表明这种变异通过加强的了针对细菌感染的保护性,而具有优势。这项研究也绘制出了驱动近代人类进化的可能适应性突变的完整列表,这将为今后的研究打下基础。(生物通:万纹)

作者: 2013-3-26
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