4日出版的国际顶尖科学期刊《自然》，以封面故事介绍由中国深圳华大基因研究院主要承担的“人体肠道菌群元基因组参考基因集的构建工作”。
该研究属于欧盟第七框架资助项目——人体肠道元基因组研究计划（MetaHIT）的一部分，得到了国家科技部国际合作司和深圳市的配套支持。
深圳华大基因研究院今天表示，作为唯一的非欧盟研究团体参与到MetaHIT计划中，该院采用高通量的测序技术和高效能的信息分析平台，取得了一系列突破性的研究成果。
人体除受自身基因的调控外，还受到大量的共生细菌的影响。这些细菌大部分寄生在人的肠道中，通称为肠道菌群，在
学术界常被称作“人体肠道元基因组”。该项研究成果收集了124个来自于欧洲人肠道菌群的样本，采用了新一代大规模高通量的测序技术进行深度测序，产出近6千亿的碱基序列。经过序列组装和基因注释分析，从中获得330万个非冗余的人体肠道元基因组的参考基因，约是人自身基因的150倍。这个基因集中包含了绝大部分目前已知的人体肠道
微生物基因，但更多的是目前未知微生物的基因。从这个基因集中可以估计人肠道中存在约1000到1150种细菌，平均每个体内约含有160种优势菌种，并且这些细菌是绝大部分个体所共有的。
科学家近10年来通过在肠道元基因组领域的研究证实，不当的饮食会导致肠道菌群的结构失衡，进而引发的慢性炎症是造成这些代谢性疾病的主要因素。但具体是哪些菌群的结构失衡，以及它们如何引发慢性炎症，对这些问题的回答现在仍处于猜测阶段。人体肠道元基因组参考基因集的构建，加深了人们对肠道微生物与人体自身健康关系的理解。（记者郑小红）
作者：
2010-3-9