近日，芝加哥大学基因组和系统生物学研究院（IGSB）的研究人员完成了
癌症基因组计划的试验阶段。这个三年的癌症基因组计划试图测定1000个
肿瘤中有差异的序列。在过去的一年中，研究人员与医生密切合作，已经获得了100个肿瘤的序列，将剩余的900个留给今后两年。
根据芝加哥大学Kevin White教授的说法，第一年的大部分时间花在确立和细化项目框架。该项目利用技术上最先进的基因组测序及计算分析平台，不过他没有指明该项目具体使用了哪些仪器。“我们现在知道该怎么做了，我们有了适当的基础结构。在这个过程中，我们发现了某些癌症中与
临床结果相关的新基因。”
癌症是一种
遗传疾病。每个肿瘤的基因都为疾病的严重程度提供了线索。它们有时能预测癌症是否会对特定治疗有反应，是否会耐受放疗或化疗，治疗后的复发和扩散。目前许多癌症疗法来自遗传信息。1958年芝加哥大学的Elwood Jensen发现了雌激素受体，导致了雌激素阻断剂tamoxifen的开发。
到目前为止，项目获得的肿瘤序列主要是白血病、
乳腺癌、头颈部癌。研究人员追踪了捐献恶性肿瘤样品的患者，以将遗传数据和患者的结果相关联。White表示，该项目旨在教会他们如何利用细胞的遗传状态作为路标，来给予特定患者更好的治疗。
对于项目的剩余部分，研究人员将致力于确定肿瘤中改变的基因如何影响癌症。项目还将扩大，延伸到更多的肿瘤类型，包括膀胱癌、
肺癌、胰腺癌、前列腺癌及一些儿童期癌症。根据White的说法，分析多种肿瘤将帮助研究人员分辨不同癌症类型之间的关系。
为了达到1000个序列的目标，研究人员将实行独特的研究过程。与其它项目不同，他们只研究在恶性肿瘤中表达的基因，大约占完整基因组的1-2%，这样每个肿瘤大约花费2000美元。White强调，为了达到项目要求，仍有待收集的数据量大约相当于20个完整的人类基因组。
该项目还会收集肿瘤中表达的基因如何随时间变化的遗传数据。研究人员会尽可能地比较患者治疗前后的肿瘤样品，来研究癌症如何累积其他的遗传改变，让它们耐受放疗或化疗，或扩散到其它地方。
White表示，该项目的长期目标是将基因组发现转化成有用的诊断工具和疗法。他也承认，让一小段基因组序列来改善患者健康，还有很长的路要走。（生物通 余亮）
作者：
2010-1-6