来自华盛顿大学基因组中心，医学院等处的研究人员利用最新的测序技术对一位
乳腺癌患者的四个DNA样本的完整序列进行了序列分析，从中发现转移
肿瘤特定选择来自原发性肿瘤的、含有业已存在突变的一个亚类的细胞，并且还会形成少量新突变。这一研究成果公布在Nature杂志上。
文章的通讯作者是华盛顿大学基因组中心主任，Richard K. Wilson博士，其参与了多项基因组序列鉴定的工作，比如前段时间完成的首个
癌症患者基因组序列测序的工作，Richard K. Wilson博士和其他研究人员利用来自皮肤样本的
遗传材料，测序了一位急性骨髓性白血病（AML）2套染色体的DNA，同时根据骨髓样本检测了其肿瘤细胞中的遗传突变。
这项研究也比对了患者的肿瘤基因组与其正常基因组，他们发现在患者肿瘤基因组中接近270万个单核苷变异中，将近98%同样也在患者皮肤样本的DNA中检测到，这就大大缩小了进一步筛选的范围。研究人员最终在患者的肿瘤DNA中仅发现了10个可能与AML有关的遗传突变，其中8个很罕见，它们所处基因之前从未被认为与AML有关。研究人员还显示，肿瘤样本中的每个细胞拥有9个突变，而且较少发生的那个突变可能是最后形成的。研究人员怀疑，所有这些突变对于患者的癌症都很重要。
目前DNA测序技术高速发展，因此有可能对整个一个基因组进行筛选，以寻找与肿瘤进展相关的基因变化。最新的文章中，研究人员从一位44岁非洲裔美国人乳腺癌患者（其所患为Basal-型乳腺癌）上获得了四个DNA样本的完整序列， 这四个DNA样本分别是：原发性肿瘤、周围血液、一个脑转移样本和一个来自原发性肿瘤的“first-passage”异种移植。突变分析表明，转移肿瘤特定选择来自原发性肿瘤的、含有业已存在突变的一个亚类的细胞，并且还会形成少量新突变。
近期癌症基因组研究获得了许多新的成果，比如加州大学洛杉矶分校的研究人员首次完成了脑癌细胞系全基因组测序，这也是截至目前对单个癌症细胞系所做的最为彻底的测序分析。通过使用最新技术，此项测序工作得以在一个月内完成，测序成本大约为3.5万美元。
此项研究成果在朝向基于单个癌症之独特生物学签名的个性化治疗方面迈出了新的一步，其所揭示的新分子靶标将有助于开发出更具效力和更少毒性的药物。此项研究对于更好地找到监测脑癌复发的新方法也大有助益，便于医生更早地对脑癌的复发做出诊断和治疗。借助此项发现，
临床医生还可测定脑癌细胞被灭活的准确时间，以防止过度使用药物对人体健康造成的损害。
测序工作是在名为U87的成胶质瘤细胞系上完成的，在全世界范围内有超过1000个实验室正在使用U87细胞系开展研究。之所以选择该细胞系，是因为目前对其的研究最为充分。此项测序工作将使那些从事细胞系研究的科学家们对他们的研究发现重新进行阐述，并促使他们提出新的前进方向。
此次测序工作揭示了几乎所有潜在的致癌染色体易位及导致该癌症发展的基因缺失和突变。研究人员从细胞系中取出遗传物质的长链，然后随机地将其截断。该癌症的数十亿个不同的DNA片段可由新一代测序技术同时进行读取，遗传物质经由10亿次以上的分析后就可确保结果具有高灵敏度和精确度。
（生物通：万纹）
作者：
2010-4-16