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全国卫生系统电视电话会议强调，目前食品安全仍存在三大问题：一是制售假冒伪劣成为当前突出的食品卫生和安全问题。二是微生物污染仍然是影响中国食品卫生和安全的最主要因素，控制细菌性污染仍然是目前解决食品污染问题的主要内容。三是种植、养殖等源头污染严重影响食品安全。农药兽药(尤其是抗生素、激素)和禁止使用的饲料添加剂的滥用、残留，是造成食品源头污染的主要原因。
对食品卫生和安全的要求，全国卫生系统要贯彻落实《国务院进一步加强食品安全工作决定》的精神，加强卫生执法监督体系建设，规范卫生许可工作，推进《食品安全行动计划》的实施，加快完善食品卫生法规标准，加强餐饮业、食堂等食品消费环节的卫生监管工作。同时。抓好食品卫生、食源性疾病监测网络和检验检测体系建设工作，建设食品卫生长效监管机制等。
目前，中国已逐步建立起以《食品卫生法》为核心，由近百个配套部门和地方法规、近五百个食品卫生标准组成的食品安全法规体系。现在，一支10万人的卫生监督队伍和 20万人的技术骨干，基本覆盖了全国食品生产经营的各个环节。而近年推行的食品卫生监督量化分级管理制度和良好的生产规范及危险分析关键控制点技术管理体系，完善了食品污染物监测网。