来自专家的分析认为，建立高效的
管理团队，构建较为理想的专业孵化器治理结构是实现生物医药孵化器的科技成果转移功能、决定其能否生存发展的关键因素。
随着我国对生物医药产业投入力度的加大及过去２０年科技研究成果的积累，产业对生物医药孵化器的孵化服务及专业技术服务的需求会逐步上升。生物医药产品的研发具有风险高、资金投入大、周期长的特点，鉴于生物医药行业的特征，生物技术的产业化过程涉及多个不同的行为主体，无论是企业、科研机构和个人，均不可能独立完成某一个生物医药项目从开发到生产的全过程。
目前我国药品科研和技术开发的主体是政府直属的科研机构和高等院校，而医药工业企业科技开发能力薄弱，只能进行简单的移植和仿制，产、研、学条块分割，科研成果转化率比较低，更谈不上根据市场需求或潜在需求进行高效率的研究开发活动。生物技术药品的产业化需要大学、研究所和企业之间的通力合作，而当前的状态是大学、研究所办企业，企业办研究所，造成技术力量分散，投资重复，资金浪费，是高科技的低水平重复，因此无法形成高水平、规模化、优质化的大生产，要改变这种状况，需要建立“研究－中试－
临床－申报－生产－市场开发”联合体，发挥各自优势，尊重知识产权，按经济规律办事，通力合作，加速产业化的进程。
孵化器的作用就是要根据生物医药产业的供应链要求，有效的整合国内、国际的相关机构的资源与优势，将产、研、学有机结合起来，建立由政府、科研机构、企业、金融等机构组成的高效运行的生物医药创新平台，有效发挥群体的协同作用。通过孵化器可实现：中小企业与大型制药企业组成联合研究体；作为高校及研究机构的风向标，使科研与产业良性互动；分散新药开发的风险。
据介绍，生物医药专业孵化器根据建设内容可分为硬件平台建设和软件平台建设。专业技术型企业孵化器除了提供通用型企业孵化器的一般办公环境外，还要为在孵企业提供专业化的实验条件、中试和专业化的技术平台，减少了初创企业公用技术设施的投入，这属于硬件平台建设方面的内容；此外，专业技术型孵化器还拥有专业化的技术支持、管理培训，在很大程度上为初创企业在技术研发、生产运作、经营管理及市场开拓方面节省成本，这属于软件平台建设方面的内容。软件平台的建设比硬件建设更为重要，专业孵化器的核心竞争力在于是否在专业技术领域具备技术优势，作为生物医药专业孵化器，组建一只掌握领域内国内一流的、具有国际水平的生物工程技术的技术队伍，是生物医药专业孵化器能否成功运作的关键。
专家认为，我国的生物技术企业大多数是技术型的公司，其产品就是项目，最终要进入产业，技术交易是一个必备的环节，作为生物医药孵化器必须帮助入驻企业解决产业链的形成。专业孵化器关键在于技术支持服务，包括项目的筛选、评价体系、对项目的帮助、平台建设中的设备操作管理人员等技术人员，在每个环节中都有技术的成分，因此，专业孵化器中必须有一批懂技术的人员，否则连和入驻企业之间的沟通都会很困难。
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