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首先，品种很重要，吴茱萸可分为大花，中花，小花。市场上最受欢迎价格最高的是中花品种。引种时应注意。吴茱萸在江西有千年的历史，而最好的品种则是江西樟树。华达中药材基地位于药都江西樟树，专业经营中花吴茱萸品种，有二十多年的历史。有专业的研究团队，丰富的病虫害管理经验，四通八达的营销网络。
其次，选择栽培的地域应不受涝或被水淹 。无论你是选山坡地还是平原地带，只要不受涝或被水淹都可以。pH值5——7.5均可。吴茱萸是一种非常耐旱耐寒的树种，除了刚栽的半年外，其余时间连续干旱二个月也不死，-30°C不做任何防冻措施也没问题，甚至到早春发芽后遇冰冻天气，芽和叶全部冻死，也可重新发芽而不影响产量。
吴茱萸几乎没有病害，因为它本身是一种消炎杀菌药。虫害有蚜虫，食叶蛾，象鼻虫和天牛。对前二种虫害一般的农药均可防治，难点是后二种。象鼻虫是一种黑色或褐色的甲壳虫，非常耐药，一般的农药奈何不了它，最好的办法是用手抓：我们可以利用它的假死。方法是：树下放一张塑料布，布的大小比树荫（中午的阳光直射的投影）稍大一些即可，用手摇动树干或用木棒敲打树枝，它就会装死掉在布上而任由我们处理。天牛分为三种：白色，黄色，红色。红色的只危害较小的树枝：把树枝的木质部横截面咬断只剩树皮，树皮上钻一个洞排出它的粪便——木屑，然后沿着树叶方向在木质部中心一直打洞。过不了二天树枝就枯死了，用手轻轻一折就断了，从断面可看到一个小洞，洞里就有红色的天牛，剖开树枝就可抓到它。白色和黄色的天牛就不好对付——它往往危害较大的树枝或树干。树皮上有新鲜的（白色）木屑就是它的粪便。防治方法：用柴刀或砍刀的刀尖砸在有木屑的树皮上，露出天牛洞，用注射器将水胺硫磷或氧化乐果原药(不要掺水）射入洞中，然后用稀泥封住洞口。或用（电工）穿线的钢丝做成的小勾把天牛从洞中勾出来，钢丝长短视洞的长短而定，有的洞有拐弯钢丝要转动几下才能进去，有的虫子很狡猾要多勾几次才能勾出来。防治天牛的原则是：越早越好。越早虫源越少越容易防治，越晚虫源越多越难防治。