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临床试验表明，连花清瘟胶囊的病毒核酸阴转时间与达菲相当，平均退热时间短于达菲，且治疗费用仅为达菲的八分之一。充分体现了中医药在抗甲型H1N1流感方面的独特优势。
军事医学科学院微生物流行病研究所在实验报告中谈到，他们采用了预处理、共处理、后处理三种不同的给药方式，分为连花清瘟组和达菲组，分别测定其治疗指数，结果发现三种给药方式连花清瘟的治疗指数均高于达菲1倍左右，为连花清瘟胶囊治疗甲型H1N1流感提供了客观实验依据。
国家中医药管理局甲型H1N1流感防治专家委员会委员、北京地坛医院中西医结合中心副主任王玉光博士介绍说，该院选取66例甲型H1N1流感患者，分别使用连花清瘟胶囊与达菲随机临床试验，结果显示连花清瘟胶囊组病毒核酸阴转时间为3.32天，达菲组病毒核酸阴转时间为3.50天；平均住院时间连花清瘟胶囊组为4.35天，达菲组为4.60天；两组平均退热时间，连花清瘟胶囊为2.13天，达菲为2.80天，统计学差异显著。在改善咽痛、咳嗽、咳痰等症状方面连花清瘟组明显好于达菲组。
目前，对于SARS、禽流感、甲型流感等呼吸道传染病的防治主要靠西药和接种疫苗，中国历史上曾发生过无数次的瘟疫流行，其中也包括流感，那时没有抗病毒药物也没有疫苗，就是应用中医中药治疗，均发挥了很好的防治作用。连花清瘟胶囊的临床与实验研究证实了中药在应对病毒传染性公共卫生事件中的重要价值，并且费用低廉，安全性高。
据了解，连花清瘟胶囊是以岭药业研发生产的专利创新中药，系国家发改委高新技术示范项目、国家级重点新产品，曾荣获了2008年度中华中医药学会科学技术一等奖。
国内多家权威机构研究证实连花清瘟胶囊具有良好的广谱抗病毒作用。广州呼吸疾病国家重点实验室研究证实体外对甲型流感病毒H3N2具有显著抑制作用，并能显著降低流感病毒FM1感染小鼠肺指数增高和肺炎死亡数。中国中医科学院研究证实体外对流感病毒甲3、副流感病毒Ⅰ型、呼吸道合胞病毒、腺病毒、单纯疱疹病毒均有抑制作用，其中对流感和副流感病毒抑制作用最强。军事医学科学院微生物流行病研究所证实体外可有效抑制SARS病毒。农业部动物流感重点开放实验室证实可有效杀灭禽流感病毒。中国疾病预防控制中心实验证实体外有效抑制EV71病毒，并且连花清瘟胶囊还有良好的抑菌消炎作用。
由于连花清瘟胶囊的广谱抗病毒作用，所以成为近年来我国病毒传染性公共卫生事件的代表性防治药物，2005年被卫生部列入《人禽流感诊疗方案》治疗人禽流感推荐用药，2008年被国家中医药管理局列入《关于在震区灾后疾病预防中应用中医药方法的指导意见》治疗感冒推荐用药，2009年被卫生部列入《人感染甲型H1N1流感诊疗方案》治疗甲型H1N1流感推荐药。
与会的中西医专家认为，相比抗病毒药物，中药具有整体调节多靶点的特点，不仅能退热消炎抗病毒，而且具有提高人体免疫机能的作用，并且比单一抗病毒药物治疗退热消炎，减轻上呼吸道症状更具优势。