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对于已患有冠心病并且有血清总胆固醇水平升高者进行的治疗称为冠心病的二级预防。外周动脉粥样硬化病和冠心病的二级预防需要进行脂蛋白分析，根据LDL-胆固醇水平进行分类。
这类病人理想的LDL-胆固醇水平是＜2.6毫摩尔/升，这类患者仍需注意饮食和适当增加体力活动，并且每年做一次脂蛋白分析，即测定LDL-胆固醇水平。当LDL-胆固醇水平超过理想状态时（＞2．6毫摩尔/升），应开始降胆固醇的饮食疗法。值得注意的是病人患有急性病或近期有外伤、手术以及患急性心肌梗塞时，都不宜进行脂蛋白分析，因为这些状态下的血脂不能反映其通常水平。急性心肌梗塞后的12周内胆固醇水平比平常低，急性期的血脂测定仅提供了一个近似值，若升高可以辅以早期治疗。
冠心病患者的二级预防是一个长期的治疗过程。其LDL一胆固醇水平的测定，应该根据相隔1～8周两次测定的平均值来作出。若两次测定值相差超过0.7毫摩尔/升，应该在1～8周内做第三次测定并使用三次测定的平均值，以此来确定今后的治疗方案。