微生物“基因语言”得到扩增

　　一个国际性研究小组扩增了描述一些致病菌、有益菌及其宿主的通用基因语言。这些新的“通用语言”被称为（GO），为研究人员提供了一套描述微生物与其宿主相互作用的术语。

　　Plant-AssociatedMicrobeGeneOntology（PAMGO）协会与欧洲生物信息学学院GO协会支持并公布了450多种描述微生物-宿主相互作用的基因产物的新术语。该计划得到国际科学基金会（NationalScienceFoundation）和美国农业部联台研究、教育和推广局(CooperativeStateResearch，EducationandExtensionService．CSREES)支持。

　　新“通用术语”有助于研发在保留有益微生物的存在的同时，能够预防致病微生物引起感染的新技术。研究人员称GO为对比一系列致病生物的基因和蛋白的功能提供了有力工具。“一种为交换微生物-宿主相互作用有关信息的通用术语，将扩大人们对微生物及其宿主的认识，”NSF分子和细胞生物学系主任MaryannaHenkart说。

　　与植物和动物有关的微生物可以是致病的、中立的或者是有益的，但与其宿主相互作用时有许多相似的过程，比如所有微生物都需要附着宿主。PAMGO一开始便设计可以用于描述植物、动物中良性、致病性微生物的术语。

　　“拥有一套可以描述致病菌、有益菌以及它们所接触的生物体的基因的术语，是弄清宿主-微生物-环境相互作用的关键，”PAMGO计划领导人、维基尼亚生物信息研究所BrettTyler说。

　　早期有许多描述微生物功能和过程的GO术语，但描述微生物在其宿主中的功能的术语却很少。PAMGO开始时致力于设计用于描述微生物与植物相互作用的术语，但很快发现几乎全部术语也可对应描述微生物和动物、人类相互作用。

　　GO协会成立后，所有使用者可以方便地为正在进行的术语规范化程序献计献策。当研究人员向PAMGO提交新术语后，整个社团参与达成一个微生物与宿主相关性的共识。

　　PAMGO协会由BVI、科内尔大学、北卡罗来那大学、麦迪逊威斯康星大学、基因组研究学会（J.C.VenterInstitute一个分部）和Wells学院合作建立，与PAMGO与GO协会联系紧密。

　　PAMGO致力于设立微生物Erwiniachrysanthemi、Pseudomonassyringaepvtomato、Agrobacteriumtumefaciens、Magnaporthegrisea、Phytophthorasojae、Phytophthoraramorum、Meloidogynehapla等与其宿主相互作用的功能术语。