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我科学家精确测定毛竹一万余条基因序列

来源:科技日报
摘要:林业基因组学研究获得重大突破。我国林业科学家日前完成包括毛竹叶片、笋和萌发种子等在内的毛竹全长互补DNA文库构建,并精确测定1万余条基因序列。这是公共数据库继模式植物水稻和拟南芥以外的第三大植物全长互补DNA数据信息资源,不仅填补了禾本科植物比较基因组学研究空白,还为开展基因组测序计划提供了有效的基因注......

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        林业基因组学研究获得重大突破。我国林业科学家日前完成包括毛竹叶片、笋和萌发种子等在内的毛竹全长互补DNA文库构建,并精确测定1万余条基因序列。这是公共数据库继模式植物水稻和拟南芥以外的第三大植物全长互补DNA数据信息资源,不仅填补了禾本科植物比较基因组学研究空白,还为开展基因组测序计划提供了有效的基因注释依据。  

  财政部、科技部支持,国家林业局立项重点支撑的这一重大项目,由中国林业科学研究院、国际竹藤网络中心与中国科学院国家基因研究中心联合承担完成。科学家首次提供了大量竹亚科基因序列信息,并根据毛竹大规模的基因序列统计了毛竹基因的一些基本信息。  

  根据鉴定到的42组禾本科同源基因,科学家进行了系统的发育树分析。分析显示,毛竹与水稻具有最近的进化关系。这为禾本科植物的研究提供了极其重要的信息,也是林业领域基因组学研究的重大突破。  

  作为大规模开展毛竹基因组测序的关键性基础研究,科学家们还顺利完成了两套高质量、高覆盖率的毛竹细菌人工染色体文库构建,为全面开展毛竹基因组测序研究的各项预研做好了准备。  

  毛竹是世界上最重要的竹类植物之一,也是中国分布范围最广、种植面积最大、经济价值最高的竹种,在禾本科植物中占有特殊地位。而禾本科类植物是人类获取食物和潜在可再生能源的主要来源。为了全面比较基因组学研究,科学工作者需要不断积累来自于不同种类的禾本科植物的基因信息和基因组信息。  

  据研究者说,目前,在公共数据库中,禾本科的大多数亚科超过100个种类,都有相应的基因组信息或表达信息,只有竹亚科(包含约1000多个种类)有少量的序列信息。
作者: 2009-1-15
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