据一篇发表于《Genome Research》的研究报告，Sanger研究所的研究人员开发出一种高通量的基因测序方法——转座子直接插入位点测序法 (Transposon Directed Insertion site Sequencing, TraDIS)，该方法只需通过一次试验就能完成对伤寒沙门氏菌(Salmonella Typhi)基因组中所有基因的测序工作。
该课题组对S. Typhi基因组的分析表明，所有基因中有256个基因是该病原菌生存必需的基因，其余4162个基因不是生存所必需的基因。了解哪些是病原生存必需基因有助于研究人员以这些基因为靶标开发出新的治疗方法。
研究人员通过TraDIS法将转座子插入到S. Typhi基因组中，产生了超过1百万个突变体。再将这些突变体细菌进行培养，通过对这些病原菌子代的基因组进行测序，发现整个S. Typhi基因组中有370,000个转座子插入位点——平均每个基因有超过80个插入位点。
如果转座子插入到生存必需的基因中，将会引起该基因沉默，而且该突变体细胞将不能生长。通过对整个突变库的DNA测序，课题组能够识别所有未插入转座子的基因。
通过利用TraDIS法，该课题组一次性的出S. Typhi基因组中99.6%对该病原菌生存必需的基因。
作者：