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关于“omes”,大家并不陌生,什么基因组学、RNA 组学、蛋白质组学等等,这些所谓的组学有多少是切实有用的呢?最新出版(2月28日)的Nature杂志就以“Big biology: The ’omes puzzle”为题,探讨了各种组学的必要性,并在封面上推出了一个填字游戏,十分有趣,大家可以去下载。
生命科学研究领域近20年来日新月异,“组学”蓬勃发展,去年纽约时报和华尔街日报就曾嘲讽过这多个以组学结尾的词语,科学家们创造出这样一个词语,然后随机添加到长长的列表后,由此发表了各种各样的科学论文。
这些组学中,其中一些已经形成了自己的知识体系和研究领域,有一些则没有必要,Nature将相关的内容进行了分类:
’Omes
Hot or not
EstablishedEmergingAspiring
Genome
The genetic material of an organismVariome
All genetic variation across a populationPhenome
Complete physical descriptions that can ideally be related to genotype
Transcriptome
All RNA expressed
from the genomeEpigenome
All elements controlling gene expression not encoded in DNARegulome
All the regulatory elements in a cell
Proteome
All the proteins in a systemInteractome
All the molecular interactions in a systemIntegrome
A combination of multiple ‘omics data sets
Metabolome
All the small molecules in a systemFluxome
Dynamics of small molecules over timeOmnisciome*
The entirety of knowledge about a cell, organism or system
并且Nature还从中选取了五个值得关注的组学研究领域,进行介绍:
Incidentalome
这个词语由波士顿儿童医院的Isaac Kohane于2006年创造,用于警告目前日益增多的遗传学信息,在未来将会给医药研究带来挑战。
这个词语来自“incidentaloma”,常被放射科医师们常用于描述“无症状的肿瘤”。因为在临床测序研究中,有时会偶然获得一些重要信息,那么在未来越来越多的人的基因组被测序,哪些信息要告诉他们呢,这将未来基因组学研究中所面临的最棘手的伦理问题。
Phenome
相比于上面的Incidentalome,表型组Phenome更容易理解一些,而且目前也已经在进行小鼠,大鼠,酵母,斑马鱼和植物拟南芥表型组的研究了。
Interactome
人体内可以说所有的元素都存在相互作用,关于互作组,科学家们已经推出了人类互作组计划——通过描绘人体内复杂的相互作用过程,可提供发现药品药品的新方法。相互作用组学可以更加详细的了解药物的作用过程。
Toxome
人类毒性计划组(Human Toxome)是针对毒理学试验的创新性研究,用以增进人类健康,减少动物使用。
Integrome
这是一个新名词,用以代表整合分析,通过各种相关的数据,获得对于事物的整体认识。