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Nature Genetics:七鳃鳗基因组测序完成

来源:生物通
摘要:现在,科学家们首次对七鳃鳗进行了全基因组测序,并将结果发表在Nature旗下的NatureGenetics杂志上。海洋生物实学验室MBL的研究人员发现,七鳃鳗基因组中存在一些与人类神经障碍有关的基因,包括阿尔茨海默症、帕金森症和脊髓损伤。MBL研究团队与密歇根州立大学WeimingLi和肯塔基大学JeramiahSmith领导的59位研究人员合作......

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七鳃鳗sea lamprey是一种有脊椎的鱼,是古代脊椎动物的代表,其分支约形成于五亿年前。现在,科学家们首次对七鳃鳗进行了全基因组测序,并将结果发表在Nature旗下的Nature Genetics杂志上。海洋生物实学验室MBL的研究人员发现,七鳃鳗基因组中存在一些与人类神经障碍有关的基因,包括阿尔茨海默症、帕金森症和脊髓损伤。

“这意味着七鳃鳗可以作为理想的分子模型,推动我们对人类神经退行性疾病和神经障碍致病机制的理解,” MBL的Jennifer Morgan说。她研究的最终目的是,确定脊髓受损时出现的问题,并想办法校正相关缺陷,使神经系统重获正常功能。

与人类不同,七鳃鳗神经系统的再生能力特别强。即使切断七鳃鳗的脊髓,其受损神经细胞仍然能够再生,在10至12周内七鳃鳗就重获游泳能力。

自2009年以来,Morgan及其同事就在研究七鳃鳗脊髓受伤后的恢复过程。七鳃鳗大脑和脊髓中的神经元较大,而且都已被鉴定过了,这也使七鳃鳗成为在单细胞水平上研究再生的理想模型。

MBL研究团队与密歇根州立大学Weiming Li和肯塔基大学Jeramiah Smith领导的59位研究人员合作,在Illumina和罗氏454平台上完成了七鳃鳗的首次全基因组测序,并进行了高质量装配。七鳃鳗测序并不容易,因为其基因组中含有大量的重复片段,GC含量也很高,此外七鳃鳗也没有什么已测序的近亲可供参考。

与人类不同的是七鳃鳗没有髓鞘,髓鞘包围着神经元能够更快的传导神经冲动。然而,研究人员发现,一些通常在髓鞘中表达的基因也在七鳃鳗中得以表达。当人体脊髓受到损伤后,髓鞘相关分子会抑制神经再生。“许多脊髓受损研究的焦点,都是中和这些抑制性的分子,” Morgan说。

“这就出现了一个有趣的问题,” Morgan说。“这些髓鞘相关基因在不含髓鞘的动物中有什么用呢,更何况这种动物的再生能力还很强。这一发现,引发了一系列吸引人的问题。”对这些基因进行研究,可以帮助人们理解为何人类在很久以前丧失了神经再生能力,以便寻找重获这一能力的途径。

现在Morgan及其同事正致力于分析,在七鳃鳗脊髓受伤后的再生过程中,哪些基因得以表达以及这些基因何时表达。这类研究将大大加速阿尔茨海默症、帕金森症和脊髓损伤的药物研发,而七鳃鳗的全基因组测序为此提供了宝贵信息。 

 

(生物通编辑:叶予)

作者: 2013-3-3
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