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根据欧委会最新推出的欧盟蓝色增长战略，欧盟第七研发框架计划（FP7）和欧盟2020地平线（H2020），迄今为止已提供900万欧元资助，总研发投入1200万欧元，积极进行欧盟海洋微生物前沿技术研发创新前瞻性部署。努力吸引欧盟及其成员国主要海洋微生物科研机构的广泛参与，包括吸引部分有助于科研成果及时转化为商业价值创新型中小企业（SMEs）的参与，打造由科技界主导的欧盟海洋微生物研发创新旗舰团队，促进欧盟研究区（ERA）建设。
截至目前，欧盟14个成员国及联系国的25家主要海洋微生物科研机构以集体会员身份参与其中，包括11家创新型中小企业。已初步建立起内部组织管理结构、紧密型合作伙伴关系、科研信息数据共享交流平台、海洋微生物数据库和进行了2轮研发创新项目社会公开招标。基本完成旗舰团队一期目标任务，将进入旗舰团队稳定可持续发展阶段。
海洋微生物，特别是极端环境条件下的海洋微生物，具有广阔的应用前景，如应用于生物酶加工、抗生素、生物医药、营养保健、化妆品或生物质燃料。但因受到生物技术知识的局限，目前的利用率不足1%。
旗舰团队在成功研制开发出大通量海洋微生物筛选隔离技术的基础上，积极开展海洋微生物生活习性、培育养殖、功能特性、遗传基因、相互关联和人工合成的前沿技术研究。已在国际著名学术刊物上发表数10篇高质量科研论文，部分科技成果已申请发明专利，正在由中小企业合作伙伴进行商业价值开发。