2007年9月，国家发改委出台《关于促进玉米深加工业健康发展的指导意见》，要求不再建设新的以玉米为主要原料的燃料乙醇项目，并大力鼓励发展以非粮作物为原料开发燃料乙醇。2007年，燃料乙醇走向了非粮乙醇发展的道路，并得到了快速发展。
2007年下半年，各大燃料乙醇企业加快了市场步伐。中粮集团实施《2007-2011年生化能源战略规划》，在广西、河北、辽宁、四川、重庆和湖北等地新建以木薯、红薯等为原料的乙醇项目。目前，中粮集团在广西、河北、内蒙古已有共计80万吨乙醇项目进入前期准备阶段，计划于2008年达产。另外，中粮集团投资的国内第一个以木薯为原料、年产20万吨燃料乙醇项目2007年年底投入生产，实现了国内清洁汽油生产以非粮作物为原料的突破。
中粮集团黑龙江500吨／年纤维素乙醇试验装置已经投料试车成功，这是世界上首次将连续汽爆技术用于纤维素制乙醇的装置。至此，中粮集团在中国东北、华北和华南等地均拥有新型燃料生产基地。
2007年11月，中石油宣布收购国内燃料乙醇龙头企业河南天冠集团55％股权。此前，天冠集团3000 吨级纤维乙醇项目生产线已投产。该项目利用纤维素废弃物制取乙醇，解决了粮食乙醇“原料价格上涨、成本过高、生产效率偏低、与人争粮”的问题。
新疆连续启动了多个“生物汽油”生产项目：新疆三台酒业(集团) 公司开工建设的利用农作物秸秆制取燃料乙醇的项目，年产乙醇10万吨，总投资2.8亿元，计划2009年完工。新疆南部莎车县与浙江浩淇生物质新能源科技有限公司共同投资12.6亿元，开发甜高粱秸秆制取燃料乙醇项目，计划年产乙醇30万吨。
虽然停止新批玉米燃料乙醇项目对燃料乙醇产生了重大影响，但众多企业在国家政策的指导下并没有停止对生物质燃料的探索，燃料乙醇企业的竞争愈演愈烈。2007年燃料乙醇仍在摸索中不断发展。
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