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医药物流是依托一定的物流设备、信息技术和进销存管理系统，有效地整合营销渠道上下游资源，通过优化药品供销配运环节中的作业过程，提高订单处理能力，缩短库存及配送时间，减少流通成本，提高服务水平和资金使用效益。未来几年甚至更长一段时间，我国的医药物流业的发展将出现以下特点：
体制多样。由于药品的特殊性、专营性以及国有主渠道作用，在很长一段时间里，这一领域一直由国有医药企业垄断。但现在，这一格局正在被打破，除了国有企业凭借其几十年的资本、网络占据着主要的领地之外，民营势力的崛起显然是一支不可小视的力量。
内外企竞合。必须承认，外企在资金、管理、技术、研发及品种结构上具有比较优势，但分销及物流配送网络是其薄弱环节。因此他们只有与国内在物流配送网络上有着一定优势的医药物流公司合作，才能有效地打开市场。此外，一些医药物流企业为了能与外企抗衡，增加自身的竞争实力，也将自身物流体系建设作为重要战略之一。
重组加剧。医药物流的发展方向是专业化、产业化、规模化。大企业有可能会寻求将中小企业纳入怀中，使之成为自己的配送中心；与此同时，中小企业也将寻求与大企业的合作，减少市场竞争风险，让自己成为大企业的区域性配送中心。医药物流领域可能会出现一批跨地区、跨所有制的大型医药物流企业。
独立的物流。这里指第三方物流的兴起与发展。医药批发业务的实质是物流配送，现在国内不仅一些老牌的医药商业企业在发展现代化的医药物流配送中心，一些新兴力量也在着手这方面的工作，如已经全面实施第三方物流的浙江邦达和正在向第三物流转型的徐州淮海医药等。有人说，第三方物流的出现可能最终威胁到医药公司的生存。因为当第三方物流企业手中掌握了越来越多的上游（生产企业）和下游（药店、医院等销售终端）资源后，他们有可能会招募一些医药营销人才或者直接并购一家医药公司，这对传统的医药流通企业是一种挑战。