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①肺为水之上源，肾为主水之脏：肺主一身之气，水液只有经过肺气的宣发和肃降，才能达到全身各个组织器官并下输膀胱，故称“肺为水之上源”。而肾阳为人体诸阳之本，其气化作用有升降水液的功能，肺肾相互合作，共同完成正常的水液代谢。肺肾两脏在调节水液代谢中，肾主水液的功能居于重要地位，所以有“其本在肾，其标在肺”之说。
②肺为气之主，肾为气之根：肺司呼吸，肾主纳气，呼吸虽为肺主，但需要肾主纳气作用来协助。只有肾的精气充沛，吸入之气，经过肺的肃降，才能使之下归于肾，肺肾互相配合共同完成呼吸的生理活动。
(2)病理
①肺失宣肃，不能通调水道，肾不主水，水邪泛滥，肺肾相互影响，导致水液代谢障碍。水液代谢障碍虽然与肺有关，但其根本仍在于肾，所以“水病下为月付肿大腹，上为喘呼，不得卧者，标本俱病”；“其本在肾，其末在肺”(《素问·水热穴论》)。由于肺脾肾三脏在调节水液代谢过程中相互联系，相互影响，发挥不同的作用，因此，治疗水液代谢病变的关键是以肾为本，以肺为标，以脾为中流砥柱。
②若肾气不足，摄纳无权，气浮于上；肺气久虚，伤及肾气，而致肾失摄纳，均会出现气短喘促，呼多吸少，动则尤甚等症。这种现象称为“肾不纳气”或“气不归根”。它的治疗，也必须用补肾纳气的方法。
此外，肺肾阴液也是互相滋养的(称为金水相生)，而肾阴又为人体诸阴之本，因此，肺阴虚可损及肾阴；肾阴虚不能上滋肺阴，则肺阴亦虚，最后导致肺肾阴虚，而见腰膝酸软，潮热，盗汗，咽干，颧红，干咳，音哑，男子遗精，女子经闭等症。如为肺痨病人、咳喘患者，病久不愈，均可出现肺肾两虚之候。