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肛腺的形态、数目和结构、分布个体差异很大,成人约4~10个,新生儿则可达50个。肛腺多数分布在肛管后部,且局限于下段肛管的粘膜下,而不会超过肛瓣平面。
肛腺导管走行弯曲而多变,可向下向外走行,可伸入内括约肌层和联合纵肌层。一个腺体的分支伸展范围约一平方厘米。
肛腺的功能是分泌多糖粘液,润滑粪便,保护肛管。但也有人认为肛腺是无分泌功能的退化组织。