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IPD的缺点是清除溶质的能力有限，特别是对中分子物质的清除不如CAPD。在透析最初的数月至数年里，透析不充分的现象可不明显，因在此期间残余肾功能对总的溶质清除仍起一定作用。当最终肾功能完全丧失时，患者就表现出透析不充分的症状和体征。另外，IPD的间歇性透析特点使体液和生化成分变化幅度比CAPD和CCPD 大，IPD透析液用量也比后二者大。