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通用引物检测脑炎患者脑脊液疱疹病毒DNA及其酶切鉴
中华微生物学和免疫学杂志 1999年第1期第19卷 免疫检测
作者:定左丽 胡芸 郭辉玉
单位:左丽(550004,贵阳医学院免疫学教研室);胡芸(贵州黔南州医院);郭辉玉(广州中山医科大学微生物学教研室)
疱疹病毒(HSV)引起的脑炎不经治疗死亡率高达70%, 若获早期诊断治疗, 死亡率可降至(19~28)%〔1〕。临床迫切需要快速、特异、敏感的诊断方法。90年代后, 陆续有用PCR对病毒性脑炎作病原诊断的报道,但用通用引物检测病人脑脊液(CSF)中疱疹病毒DNA的报道并不多见。我们选择疱疹病毒科病毒DNA多聚酶基因高保守区一对引物,对中枢神经系统(CNS)感染病人CSF作PCR扩增和病毒分离,以研究病毒性脑炎的快速诊断方法。
材料与方法
1.标本:80例病人的80份CSF由贵州省黔南州医院等单位提供。其中A组30例,均为出生1年内婴儿;B组25例,2~83岁;C组25例,1~76岁。A、B两组参照文献〔2,3〕临床诊断为“散发性脑炎”;C组为疑为CNS感染病人。采集发病2~30天CSF,-30℃保存备用。
2.主要试剂:Taq DNA聚合酶、dNTP、蛋白酶K、 SmaI 限制性内切酶、 琼脂糖、DMEM等购于华美生物工程有限公司。余为分析纯试剂。
3.毒株和菌株:HSV-1(F株)、HSV-2(G株)、CMV(AD169)、EBV(B95-8),结核杆菌和脑膜炎双球菌均由本室保存。
4.细胞:Hep-2、Vero、HEL由本室保存。
5.引物:参考文献〔5〕发表序列,扩增靶序列位于疱疹病毒科病毒DNA多聚酶基因区。
上游引物序列:5'-CGACTTTGCCAGCCTGTACC-3'; 下游引物序列:5'-AGTCCGTGTCCCCGTAGATG-3'。
扩增片段HSV为518bp;EBV为524bp;CMV为589bp。委托中山医科大学遗传室合成。
6.病毒分离:将待测CSF作10-1、10-2和10-3稀释后接种Hep-2、Vero和HEL单层细胞, 每稀释度3瓶,设HSV-1、CMV和不加病毒对照;以HSV-1在48~72小时内出现明显细胞病变(CPE);CMV接种HEL在15天内出现CPE;正常细胞无自然蜕变;待测标本不出现CPE,冻融3次后盲传2代,仍不出现CPE视为阴性。
7.病毒DNA提取:400μl CSF加等量裂解液(0.2mol/L Tris-HCl pH7.5;25mmol/L EDTA;0.3mol/L NaCl;2%SDS和蛋白酶K)混匀后56℃水浴1~2小时; 常规配制酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1);DNA沉淀溶于20μl三蒸水,-30℃短期保存备用。
8.PCR扩增:反应体积50μl。常规加入各种试剂,引物和模板,三蒸水补足量。混匀后94℃变性7分钟,72℃加入Taq DNA聚合酶1.5U,石蜡油封顶; 电热恒温水槽手工进行PCR,循环:92℃ 60秒,58℃ 60秒,72℃ 90秒,循环30次,末次72℃ 7分钟。每次实验设阳性及阴性对照。
9.PCR产物检测:取10μl PCR产物置1.5%琼脂糖凝胶(含溴乙锭0.5μg/ml)电泳,电流40mA,电压5V/cm,电泳缓冲液0.5×TBE,40分钟。紫外透射仪观察结果。 设DNA分子量标准对照。
10.PCR产物酶切鉴定:取PCR产物10μl置于0.5ml eppendorf管,加2μl 10×酶切缓冲液,SmaⅠ10U,三蒸水补至20μl,37℃ 2小时。观察结果同上。
结 果
1.病毒分离:80份CSF均未分离到病毒。
2.患者主要临床资料和PCR结果:A、B两组病人CSF分别有22和18份检出疱疹病毒DNA,C组无阳性。
3.PCR敏感性和特异性:提取HSV-1 DNA,紫外分光光度计定量后作不同稀释,PCR扩增,可检出10fg HSV-1 DNA。仅有疱疹病毒科4种病毒DNA有特异性扩增, 分子量大小与理论值相等。余病原体均为阴性。
4.PCR产物酶切鉴定:用SmaⅠ对HSV-1、-2、CMV、EBV和病人CSF阳性PCR产物作酶切分析。可将HSV-1切为476bp和42bp两个片段;将EBV切为424bp和100bp两个片段;CMV和HSV-2不被酶切。
5.病人CSF PCR检测结果:从表1可见,“散发性脑炎”患者CSF疱疹病毒DNA检出率为72.73%;A、B两组检出率差异无显著性(P>0.05);但两组不同型别HSV 检出率差异有显著性(P<0.001)。1岁以上CNS感染患者(B+C组)疱疹病毒DNA检出率为36%(18/50)。
表1 两组病人脑脊液中HSV DNA检出情况
A组 | B组 | |||
阳性数 | (%) | 阳性数 | (%) | |
HSV1 | 2 | (6.67) | 15 | (60.0) |
HSV2 | 20 | (66.66) | 2 | (8.0) |
CMV | 0 | (0) | 1 | (4.0) |
EBV | 0 | (0) | 0 | (0) |
总数 | 22 | (73.33) | 18 | (72.0) |
注:A组30份样品,B组25份样品
讨 论
本研究表明,贵州省临床诊断为“散发性脑炎”的患者中,疱疹病毒感染占有较大比例(40/55);而1岁以上CNS感染患者(B+C组)疱疹病毒DNA阳性率为 36% (18/50)。1岁内患儿HSV-2感染率较高(19/22);1月内新生儿HSV-2感染占100%(11/11);B组2例HSV-2感染者也仅2~3岁,究其原因可能与出生时经过被HSV-2感染的产道有关。B组HSV-1感染较常见,1例CMV感染者已76岁,并在发病前5 月因肺癌接受化疗,证明免疫力低下者易发生CMV感染。80份患者CSF均未分离到病毒,证实病毒分离敏感性差。而利用PCR技术,可在发病第2天病人CSF中检出疱疹病毒DNA。我们用一对引物一次PCR扩增可同时检测4种病毒。
本课题受贵州省教委基金资助
参考文献
[1]Koenig HS,Rabinowitz ED, Miller V. Post infectious encephalomyelitis after successful treatment of herpes simplex enceplalitis with adenine arabinoside. U1trastructural observations. N Eng1 J Med, 1979,300∶1089-1093.
[2]沈伯均,傅曾矩,主编.最新儿科诊疗手册.天津:天津科学出版社,1995,386-387.
[3]李德香,徐玉祥,陈玉芳,等主编.简明神经科学. 北京:人民卫生出版社,1996,288-295.
[4]Kouzarider T,Bankier AT, Satchwell SC, et al. Sequence and transcription analysis of the human cytomegalovirus DNA polymerase gene.J Virol, 1987,61∶125-133.
(收稿:1997-09-12 修回:1998-07-29)