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2007年12月27-28日，病原所举办了2007年全所工作总结会暨第二届科学年会。总结会上，各行政管理部门根据本部门工作职责进行了年度工作汇报。科学年会上，病毒基因工程国家重点实验室、艾滋病研究中心、与生物梅里埃共建的克里斯托弗·梅里埃实验室、寄生虫学联合实验室、协和临床病原研究中心以及结核病相关课题组的负责人结合科研工作的进展情况做了精彩的汇报。
张元禄书记和金奇所长分别就研究所2007年党委和所的全面工作进行了总结报告，并提出了明年的工作要点。张元禄书记从继续抓好职工的政治理论学习，做好思想政治工作，加强领导班子建设、中层管理干部队伍建设、党组织自身建设、党风廉政建设和精神文明建设等方面对2008年党委工作进行了安排部署。金奇所长则结合研究所的发展目标提出了研究所2008年的工作重点：进一步推进基本建设工作，为研究所的发展创造更广阔的空间；做好病毒基因工程国家重点实验室的共建工作；加大人才引进力度和人才培养，加速人才队伍建设；组织力量、合理布局，强化平台建设，承担和完成好国家重大专项任务；继续推进科研合作交流，进一步加强与北京市疾病预防控制中心、北京结核病控制研究所的合作；继续做好安全管理工作，为2008年奥运会做好保障；加强与企业的合作，推进产业化工作；强化制度建设，不断提高管理水平；积极申报国家项目；争取更多经费支持；做好研究生教育管理工作。
此次会议的召开，不仅进一步回顾总结了病原所2007年的各项工作，而且明确了研究所未来的发展目标和工作思路，也为科研人员搭建了沟通交流的平台，对病原所各项工作的发展具有重要的推动作用。