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2008年6月24日，病原所与医学生物学研究所（以下简称“生物所”）在昆明举行“中国医学科学院医学生物学研究所/病原生物学研究所分子流行病学联合实验室”合作协议签约仪式。詹启敏副院校长为联合实验室揭牌，金奇所长与生物所李琦涵所长共同签署了合作协议。院校科研处邢若齐处长、基础所王恒所长、病原所陈启军教授等人与生物所孙茂盛副所长、徐维明副书记、杨净思副所长、所长助理胡云章教授等人出席了仪式。
在签约仪式上，詹启敏副院校长代表院校对病原所和生物所的合作表示祝贺。詹院长指出，病原所作为我国目前最大编制的专门从事病原生物学研究的新建所，在传染病研究领域中成长迅速，是一支生机勃勃的队伍；生物所作为有50年历史的老所，在疫苗研发方面积累了丰富的经验。两所具有历史意义的忘年之交将带来合作双赢的机会，希望两所统筹科技和产业资源，满足我国重大传染病防治的需要，从整体上提升我国分子流行病学研究和疫苗产业化的原始创新能力和核心竞争力。同时对两所整合院校资源，进行跨学科、跨地区合作方式的探索给予充分肯定。
金奇所长从病原所发展目标、承担任务、队伍建设、技术体系、运行管理机制创新等方面做了简要介绍，表示将响应院校要求，与兄弟院所整合优势力量、不断提升科研实力、为国家疫苗研发、升级换代发挥更大的作用。生物所李琦涵所长也表示，在院校领导的指导、在兄弟所院的帮助下，将会继往开来、有所作为。院校科研处邢若齐处长、基础所王恒所长也表达了对“分子流行病学联合实验室”的祝愿，以及希望医科院各所院继续加强交流、共同努力把工作做好的决心。
揭牌仪式后，詹启敏副院校长一行参观了400多平米新装修的实验室，生物所的疫苗生产车间和实验动物中心。