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为深入推进我校校院二级管理改革，进一步完善管理体制和运行机制，2010年8月29日，南京中医药大学校院二级管理改革工作研讨会在先声药业会议中心成功召开。会议由党委黄成惠书记主持。校长吴勉华、党委副书记马家忠、副校长蔡宝昌、段金廒、黄桂成、夏有兵、原党委副书记王家法等校领导出席了会议，各部门、各学院、各单位的领导参加了研讨会。
会上，校长办公室程海波主任围绕校院二级管理改革工作作了专题报告，系统回顾总结了我校自2009年9月起推进的校院二级管理改革工作，对校院二级管理改革中存在的问题、解决的思路、下一步推进的工作重点进行详细汇报，并解读了党政工作目标管理考核评估实施方案。在为期一天的会议时间里，经过主题报告、分组讨论、大会交流等会议环节，与会领导就“校院二级管理改革工作推进情况”、“党政工作目标管理考核评估实施方案”、“启动新一轮校内津贴分配改革”等议题进行了认真研讨。大家一致认为，实施校院二级管理改革有效激发了校院二级办学积极性，管理运行机制更加高效，办学资源进一步优化配置。校院二级管理改革工作的推进是顺应目前高校管理改革发展趋势的需求，是我校建设“国内一流、国际著名”的研究教学型中医药大学的内在要求，也是学校事业科学发展的必然结果。同时，对工作中存在的问题和困难，代表们也纷纷发表了各自意见和建议，为继续深入推进我校校院二级管理改革工作积极献计献策。
吴勉华校长在会上简要通报了全省教育工作会议精神，他指出深化教育管理体制改革是教育部和江苏省明确提出的高等学校的一项重要工作，我校对校院二级管理改革进行了有益的探索，并已被省教育厅列入管理体制改革试点高校，我们一定要按照“积极稳妥、有序推进”的工作思路继续不断深化改革工作。
黄成惠书记最后做了总结发言。他充分肯定了学校推进校院二级管理改革一年来的工作及所取得的成效，并强调全校上下一定要进一步统一思想，坚定不移地继续深入推进校院二级管理改革工作，探索建立党政工作目标管理考评机制，全面促进学校事业的科学发展。黄书记要求，各单位要积极面对和解决工作中遇到的问题和困难；机关职能部门在校院二级管理改革工作中要发挥引领作用，二级单位要加强领导班子建设，结合单位实际，认真做好自身的二级管理改革工作，激发调动教研室和广大教职工的积极性。