广东地区人禽流感H5N1毒株神经氨酸酶基因的特征与变异

2008年04月10日 《中华传染病杂志》-2007年25卷10期 -589-592页 医学空间（MEDcyber.com）4月10日消息，该项研究目的是通过对人禽流感H5N1毒株神经氨酸酶（NA）基因序列变异的分析，揭示毒株NA基因的变异与进化。方法采用检测广东GD01—06毒株NA基因核苷酸序列，同时对全球各地人禽流感H5N1毒株NA基因进行检索，采用DNAStar 5．0软件对检索的人禽流感H5N1毒株NA基因核苷酸序列进行比对和分析；并结合地区资料对变异毒株进行进化速度分析。结果1997至2006年53株毒株NA基因112个氨基酸位点全部置换，占24．9％（112／450）；53株毒株分为两个系列：1997年人禽流感毒株为-个系列，2003至2006年毒株为另-系列。毒株GD-01-06与PC6231-04核苷酸序列同源性为94．1％，与1997、2004至2005年毒株比较，毒株GD-01-06发生Y081H、E363G位点置换。2003至2006年所有毒株均丢失第53位异亮氨酸，且第49位半胱氨酸置换为异亮氨酸，改变蛋白质二级结构。与同义突变比较，毒株GD-01—06的NA基因错义突变错义进化速率（Ka）大于同义进化速率（Ks），显示NA基因进化受到明显选择性免疫压力。得出结论1997至2006年53株毒株NA基因进化分为两个系列；NA基因进化受到明显选择性免疫压力；2003至2006年毒株C049I置换，导致蛋白质二级结构改变，其意义尚待探讨。