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同一研究组两篇文章发表病毒新成果

来源:生物通
摘要:早年毕业于法国奥尔良大学的VincentDEUBEL博士对病毒学研究情有独中,多年来他一直从事着致病病毒的研究,近期其研究组获得了这方面的两项新成果。第一篇文章发表在国际知名临床微生物学杂志《JournalofClinicalMicrobiology》上,这项研究用发现了可用于A型流感HA基因亚型分型的多重荧光PCR方法。这项研究建立了4组荧光......

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早年毕业于法国奥尔良大学的Vincent  DEUBEL博士对病毒学研究情有独中,多年来他一直从事着致病病毒的研究,近期其研究组获得了这方面的两项新成果。

第一篇文章发表在国际知名临床微生物学杂志《Journal  of  Clinical  Microbiology》上,这项研究用发现了可用于A型流感HA基因亚型分型的多重荧光PCR方法。

A型流感的暴发是人-人或者人-禽传染的结果。追踪季节性流感和禽流感的基因亚型,特别是那些能感染人,水禽,迁徙禽类,家禽和猪的流感亚型,有助于疾病流行病学监测和预警。

这项研究建立了4组荧光RT-PCR反应体系,结合SYBR染料标记,Taqman探针和分子信标技术,可以一次鉴别A型流感M基因和6种HA基因亚型(H1,  H2,  H3,  H5,  H7,  H9)。该6种HA亚型可以感染人,鸟和猪。该方法检测敏感度可达到10-100个病毒RNA拷贝数,可检测出至少6种东南亚地区H5亚型。这一方法并已通过临床标本验证。结合Smartcycler荧光PCR仪,该方法建立了一个快速有效,灵活可靠的A型流感监测平台,可用于医院和野外现场调查。



第二篇文章发表在PLoS  ONE杂志上,这篇文章首次在一种新病毒-鼻病毒C中发现大量多重重组。

鼻病毒和流感病毒,呼吸道合胞病毒是儿童呼吸感染主要致病病毒。鼻病毒分为3种亚型:即HRV-A,  HRV-B和HRV-C亚型。2006年美国首次发现了HRV-C。上海巴斯德研究所新生病毒研究组研究人员与上海南翔医院儿科合作,通过系统研究急性呼吸道感染致病病毒,发现HRV-C在所有鼻病毒感染病例中占50  %以上。其中,一半以上含有一个长度不一属于HRV-A的5’端的基因片段。该发现表明HRV-C可以分为两个新亚种。通过新亚种全基因组测序,研究人员还发现了基因组其他位置的重组点。此外,分析表明HRV-A和HRV-C共感染可能是产生病毒重组的原因。

这项研究同时证明儿童人群存在鼻病毒高遗传多样性,该样本人群在同一医院就诊,来自有一百万居民的同一社区,其中40%是外来人口。这表明,鼻病毒在这样的社区内有很高的进化能力。鼻病毒C主要是在支气管炎和肺炎门诊儿童病人中发现的,然而,重组导致5  '端非编码区二级结构变化对病毒扩增周期的影响尚未确定,因为它无法进行细胞培养也不能感染小鼠。这项研究首次提出,与脊髓灰质炎病毒相似,不同鼻病毒有重组能力。导致极大的病毒多样性,从而使病毒诊断和分离更加困难。



(生物通:万纹)
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