人类免疫缺陷病毒-1的核酸遗传学特点

2006年08月28日 中华传染病杂志 2006 Vol.24 No.3 P.152-154 8 （深圳）为了研究人类免疫缺陷病毒(HIV)-1膜蛋白基因(env)的准种与变异特点。研究者采用套式聚合酶链反应(PCR)对5例艾滋病患者血浆HIV-1 env基因C2～V3区进行PCR扩增，产物经纯化后克隆至pMD-18T载体中，每例患者分别挑取5～8个克隆，共34株，完成阳性克隆的鉴定、抽提纯化和测序，将获得的DNA序列及核苷酸序列进行分析，并计算其核苷酸同源替换率(ds)与非同源替换率(dn)的比值。结果同一患者体内HIV准种株平均为83.5%，各克隆株之间的核苷酸同源性在88%～99%之间；不同患者之间的核苷酸同源性在75%～91%；34株序列的V3区平均变异频率明显高于C2～C3区(P＜0.05)；而V3区和C2～C3区的ds/dn比值均＞1。可见艾滋病患者体内有大量HIV准种存在，基因的变异在V3区发生较频繁，免疫选择压力在该区变异中不起主要作用。