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新方法找到与2型糖尿病相关的11个基因变异体

来源:生命经纬
摘要:最近,密西根理工大学的数学家开发出一项新软件——EnsembleLearningApproach(ELA),ELA可用于比较不同个体之间的基因组成,从中分选出疾病相关的基因。此外,他们还发现了2型糖尿病相关基因的11个突变体,即单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)。像2型糖尿病这种复杂的遗传疾病,单个基因突变可能促成该......

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最近,密西根理工大学的数学家开发出一项新软件——Ensemble  Learning  Approach  (ELA),ELA可用于比较不同个体之间的基因组成,从中分选出疾病相关的基因。研究人员利用该软件能够找出某些人类遗传病的致病基因。此外,他们还发现了2型糖尿病相关基因的11个突变体,即单核苷酸多态性(single  nucleotide  polymorphisms,  SNPs)。这项研究发表在《Genetic  Epidemiology》杂志上。

像2型糖尿病这种复杂的遗传疾病,单个基因突变可能促成该病的发生,多个基因共同作用也可能引起该病。过去,很难针对多个基因间的相互作用进行研究,因为要将人类基因组中约50万个基因匹配起来再进行计算几乎不可能实现。

而ELA软件避开上述问题,首先,将基因研究的范围缩小到只包括潜在的致病基因;再通过统计学方法计算出哪些SNPs是能单独致病,哪些需要多个基因共同作用才能致病。为了测试他们建立的模型在实际数据上的有效性,课题组在英国对1,000人进行基因分析——包括500名2型糖尿病患者,500名健康人。他们发现有11个SNPs引起该2型糖尿病的可能性很高。
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