据一篇发表于10月22日《Nature》杂志的报告,研究人员对大肠杆菌(Escherichia coli)研究中,首次发现单链DNA结合蛋白(single-stranded DNA-binding protein, SSB)能够在单链DNA上能随机地来回移动,并协同其他蛋白质对单链DNA完成修复,重组或复制的功能。
在复制和重组过程中,dsDNA解旋是必不可少的一步,尽管该过程非常短暂,但解开的ssDNA极易被损坏或被细胞内的酶降解,而且,被破坏的DNA易与自身互补配对,形成发夹结构或其他有问题的结构。
SSB蛋白由四个相同的亚基组成。ssDNA环绕在SSB周围形成“棒球接缝”的模式穿过其中。DNA进出的位点彼此非常靠近,这使得ssDNA与SSB之间的相互作用可以通过荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer, FRET)技术进行研究。
FRET技术使用的荧光分子所发出的信号的强度依据其接近程度不同而定。通过利用红绿染料对不同长度ssDNA进行标记,可以对每65个核苷酸(穿过SSB蛋白的ssDNA链的长度)进行分离并追踪与SSB结合的ssDNA链的FRET信号。
通过一系列实验表明,SSB能够随机的分散在ssDNA链上;研究人员发现了一种重要的DNA修复蛋白RecA能与SSB在ssDNA链上并行移动,从而防止SSB向ssDNA链相反的方向运动。此外,他们还发现,SSB能够解开ssDNA上小的“发夹环”,使得RecA能与单链进行结合并进行修复。SSB通过这种方式能够调节RecA的活性及其他参与DNA修复,重组和复制的蛋白质的活性。(编译:高芳)
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